Διαφορά μεταξύ Sense και Antisense Strand

Κύρια διαφορά – Sense vs Antisense Strand

Το νόημα και το αντινόημα είναι οι δύο όροι που χρησιμοποιούνται για να περιγράψουν τους δύο κλώνους στο δίκλωνο DNA, βάσει του οποίου κλώνος χρησιμεύει ως πρότυπο για τη μεταγραφή. Ο κλώνος αίσθησης περιέχει την ακριβή αλληλουχία νουκλεοτιδίων στο mRNA που κωδικοποιεί μια λειτουργική πρωτεΐνη. Ο αντιπληροφοριακός κλώνος χρησιμεύει ως εκμαγείο για τη μεταγραφή και περιέχει συμπληρωματική νουκλεοτιδική αλληλουχία προς το μεταγραφόμενο mRNA. Επομένως, ο αντιπληροφοριακός κλώνος είναι υπεύθυνος για τη μετάφραση πρωτεϊνών. Η κύρια διαφορά μεταξύ νόημα και αντιπληροφοριακού κλώνου είναι ότι ο νοηματικός κλώνος δεν μπορεί να μεταγραφεί σε mRNA ενώ ο αντιπληροφοριακός κλώνος χρησιμεύει ως πρότυπο για τη μεταγραφή.

Αυτό το άρθρο εξερευνά,

1. Τι είναι το Sense Strand
      – Ορισμός, Χαρακτηριστικά, Δομή
2. Τι είναι το Antisense Strand
      – Ορισμός, Χαρακτηριστικά, Δομή
3. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Sense και Antisense Strand

Τι είναι το Sense Strand

Ο κλώνος αίσθησης θεωρείται ως ο κωδικοποιητικός κλώνος του δίκλωνου DNA, ο οποίος εκτείνεται από την κατεύθυνση 5' έως την κατεύθυνση 3', με βάση τον κλώνο προτύπου που εκτείνεται από το 3' προς την κατεύθυνση 5'. Θεωρείται με τη θετική έννοια. Ο νοηματικός κλώνος περιέχει τη συμπληρωματική νουκλεοτιδική αλληλουχία προς τον αντιπληροφοριακό κλώνο του δίκλωνου DNA. Το mRNA περιέχει την ίδια αλληλουχία νουκλεοτιδίων με τον κλώνο αίσθησης, που εκτείνεται από την κατεύθυνση 3' έως 5'. Ο αισθητικός κλώνος περιέχει κωδικόνια, τα οποία είναι οι τριπλέτες νουκλεοτιδίων, που προσδιορίζουν ένα μοναδικό αμινοξύ στην πολυπεπτιδική αλυσίδα. Τα κωδικόνια, τα οποία χρησιμοποιούνται από τα γονίδια για να κωδικοποιήσουν μια λειτουργική πρωτεΐνη ονομάζονται συλλογικά ως γενετικός κώδικας, ο οποίος θεωρείται ως ένα καθολικό χαρακτηριστικό σχεδόν όλων των ζωντανών μορφών.

Εικόνα 1:Σκέλος λογικής και αντιπληροφορίας

Απλώς μετά την παρακολούθηση της μεταγραφής, το mRNA που προκύπτει ονομάζεται πρωτεύον μεταγραφή. Το πρωτογενές αντίγραφο αποτελείται από την ακριβή αλληλουχία νουκλεοτιδίων του νοηματικού κλώνου, εκτός από την ουρακίλη, η οποία υπάρχει αντί της θυμίνης. Η κύρια μεταγραφή μπορεί να υποβληθεί σε πρόσθετη επεξεργασία πριν εκτεθεί στις μετα-μεταγραφικές τροποποιήσεις. Η αφαίρεση των ιντρονίων με μάτισμα και η προσθήκη 5' καλύμματος και 3' ουράς πολυ-Α είναι οι μετα-μεταγραφικές τροποποιήσεις, οι οποίες περιλαμβάνουν την παραγωγή ενός ώριμου mRNA.

Τι είναι το Antisense σκέλος

Ο συμπληρωματικός κλώνος προς τον κλώνο αίσθησης στο δίκλωνο DNA αναφέρεται ως αντιπληροφοριακός κλώνος, ο οποίος εκτείνεται από την κατεύθυνση 3' έως την κατεύθυνση 5'. Ο αντιπληροφοριακός κλώνος θεωρείται ως με την αρνητική έννοια. Χρησιμεύει ως πρότυπο για τη σύνθεση mRNA, τη μεταγραφή. Επομένως, ο αντιπληροφοριακός κλώνος είναι υπεύθυνος για την αλληλουχία αμινοξέων του μεταφρασμένου πολυνουκλεοτιδίου. Ο αντιπληροφοριακός κλώνος περιέχει αντικωδικόνια, τα οποία είναι οι τριπλέτες νουκλεοτιδίων που βρίσκονται στα tRNA. Το αντικωδικόνιο είναι συμπληρωματικό του κωδικονίου. Κατά τη διάρκεια της μεταγραφής, η RNA πολυμεράση, που είναι το ένζυμο που εμπλέκεται στη μεταγραφή, προσθέτει συμπληρωματικά νουκλεοτίδια στον κλώνο του εκμαγείου. Το mRNA σύνθεσης συνδέεται προσωρινά στον κλώνο του εκμαγείου με το σχηματισμό δεσμών υδρογόνου με τις συμπληρωματικές τους βάσεις στον κλώνο του εκμαγείου. Η RNA πολυμεράση προσθέτει ουρακίλη ως συμπληρωματική βάση στην αδενίνη αντί της θυμίνης.

Οι κλώνοι αίσθησης και αντιπληροφορίας παίζουν κρίσιμο ρόλο στην παρεμβολή RNA μέσα στο κύτταρο. Η παρεμβολή RNA είναι ένας φυσικός μηχανισμός, ο οποίος χρησιμοποιείται από τα κύτταρα για τη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης. Κατά τη διάρκεια της παρεμβολής RNA, η έκφραση γονιδίου καταρρίπτεται από την παραγωγή ενός αντιπληροφοριακού κλώνου ολιγονουκλεοτιδίου DNA, ο οποίος μπορεί να συζευχθεί συμπληρωματικά με βάση τον μεταγραφόμενο κλώνο mRNA ενός συγκεκριμένου γονιδίου. Η σχηματιζόμενη δομή δίκλωνου RNA-DNA αποκόπτεται από σύμπλοκα πρωτεΐνης Dicer, καθαρίζοντας το mRNA από το σύστημα. Ο μηχανισμός στην παρεμβολή RNA φαίνεται στην εικόνα 2.

Εικόνα 2:Μηχανισμός παρεμβολής RNA

Διαφορά μεταξύ λογικής και αντιπληροφοριακού σκέλους

Κατεύθυνση

Sense Strand: Το σκέλος της αίσθησης κατευθύνεται προς την κατεύθυνση 3' προς 5'.

Antisense Strand: Το αντιπληροφοριακό σκέλος κατευθύνεται προς την κατεύθυνση 5' προς 3'.

Μεταγραφή

Sense Strand: Η λογική αλυσίδα δεν μεταγράφεται σε mRNA.

Antisense Strand: Ο αντιπληροφοριακός κλώνος μεταγράφεται σε mRNA.

Αγγελιοφόρος RNA

Sense Strand: Ο αντιπληροφοριακός κλώνος περιέχει την ίδια νουκλεοτιδική αλληλουχία με το mRNA, εκτός από τη θυμίνη.

Antisense Strand: Ο αντιπληροφοριακός κλώνος είναι ο κλώνος μήτρας για τη σύνθεση RNA. Επομένως, περιέχει τη συμπληρωματική νουκλεοτιδική αλληλουχία του mRNA.

Κωδόνιο/Αντικωδόνιο

Sense Strand: Ο κλώνος αίσθησης περιέχει κωδικόνια.

Antisense Strand: Το αντιπληροφοριακό σκέλος περιέχει αντικωδικόνια.

Δεσμός υδρογόνου

Sense Strand: Δεν σχηματίζονται δεσμοί υδρογόνου μεταξύ της νοηματικής αλυσίδας και του mRNA σύνθεσης.

Antisense Strand: Τα νουκλεοτίδια στον αντιπληροφοριακό κλώνο συνδέονται προσωρινά με υδρογόνο με τα συμπληρωματικά νουκλεοτίδια στο mRNA που συντίθεται.

Μεταφορά RNA

Sense Strand: Ο κλώνος λογικής περιέχει τη συμπληρωματική νουκλεοτιδική αλληλουχία ως το tRNA.

Antisense Strand: Ο αντιπληροφοριακός κλώνος περιέχει την ίδια νουκλεοτιδική αλληλουχία με το tRNA.

Συμπέρασμα

Οι δύο κλώνοι DNA στο δίκλωνο DNA αναφέρονται ως νόημα και ως αντινοηματικοί κλώνοι. Η ονομασία των δύο κλώνων ως νόημα και αντιπληροφοριακό είναι σχετική με την προοπτική του κλώνου προτύπου. Το αντιπληροφοριακό σκέλος, το οποίο εκτείνεται από την κατεύθυνση 3' έως 5' χρησιμεύει ως πρότυπο κατά τη διάρκεια της μεταγραφής. Τα συμπληρωματικά νουκλεοτίδια στον αντιπληροφοριακό κλώνο προστίθενται στον κλώνο mRNA από το ένζυμο RNA πολυμεράση. Ο κλώνος αίσθησης εκτείνεται από την κατεύθυνση 5' έως 3', που περιέχει την ίδια αλληλουχία ζεύγους βάσεων στο μεταγραφόμενο mRNA. Ως εκ τούτου, η λογική κλώνος ονομάζεται κλώνος κωδικοποίησης. Ο αντιπληροφοριακός κλώνος ονομάζεται μη κωδικοποιητικός κλώνος. Περιέχει αντικωδικόνια, ίδια με το tRNA. Η κύρια διαφορά μεταξύ της λογικής και της αντιπληροφοριακής αλυσίδας είναι ότι χρησιμεύουν ως πρότυπο για τη μεταγραφή.

Αναφορά:
1.Griffiths, Anthony JF. «Δημιουργία λειτουργικών μεταγραφών». Σύγχρονη Γενετική Ανάλυση. U.S. National Library of Medicine, 01 Ιανουαρίου 1999. Web. 23 Μαρ. 2017.