Ποια μετάλλαξη θα πρέπει να απαιτεί λιγότερο την επανευθυγράμμιση των ομόλογων περιοχών ένα γονίδιο που είναι κοινό σε διάφορα συναφή είδη;
Εδώ είναι γιατί:
* Συνώνυμες μεταλλάξεις είναι μεταβολές στην αλληλουχία ϋΝΑ που δεν μεταβάλλουν την αλληλουχία αμινοξέων της πρωτεΐνης που κωδικοποιείται από το γονίδιο. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι ο γενετικός κώδικας είναι περιττός, που σημαίνει ότι πολλαπλά κωδικόνια μπορούν να κωδικοποιήσουν το ίδιο αμινοξέο.
* Μη-συνώνυμες μεταλλάξεις , από την άλλη πλευρά, αλλάξτε την αλληλουχία αμινοξέων, η οποία μπορεί ενδεχομένως να μεταβάλει τη λειτουργία και τη δομή της πρωτεΐνης.
* παρεμβολές και διαγραφές (Indels) μπορεί να προκαλέσει μετατοπίσεις πλαισίου, οδηγώντας σε σημαντικές αλλαγές στην αλληλουχία πρωτεϊνών και απαιτώντας εκτεταμένη επανευθυγράμμιση.
Δεδομένου ότι οι συνώνυμες μεταλλάξεις δεν αλλάζουν την αλληλουχία πρωτεΐνης, έχουν ελάχιστη επίδραση στη συνολική δομή και τη λειτουργία του γονιδίου. Αυτό τους καθιστά λιγότερο πιθανό να διαταράξουν την ευθυγράμμιση των ομόλογων περιοχών σε διάφορα είδη.
Ως εκ τούτου, μια συνώνυμη μετάλλαξη θα απαιτούσε ελάχιστη επανευθυγράμμιση των ομόλογων περιοχών σε ένα γονίδιο κοινό σε διάφορα συναφή είδη.