Οι θαλάσσιοι οργανισμοί ταξινομούνται ανάλογα με το πώς αυτοί.

Οι θαλάσσιοι οργανισμοί ταξινομούνται ανάλογα με τον τρόπο με τον οποίο αλληλεπιδρούν με το περιβάλλον τους . Αυτό μπορεί να αναλυθεί σε διάφορους βασικούς παράγοντες:

* Habitat: Όπου ζουν (π.χ. βαθιά ωκεανός, κοραλλιογενής ύφαλος, ενδιάμεση ζώνη)

* τρόπος ζωής: Πώς κινούνται (π.χ. κολύμπι, ανίχνευση, αλεξίπτωτο) και πώς λαμβάνουν τρόφιμα (π.χ. τροφοδοσία φίλτρου, θήρευση)

* Φυσιολογικές προσαρμογές: Πώς αντιμετωπίζουν συγκεκριμένες περιβαλλοντικές συνθήκες (π.χ. αλατότητα, πίεση, θερμοκρασία)

* Ταξινομική ταξινόμηση: Αυτό περιλαμβάνει τους οργανισμούς ομαδοποίησης που βασίζονται στην κοινή εξελικτική ιστορία, από το ευρύτερο επίπεδο (βασίλειο) έως τα πιο συγκεκριμένα (είδη).

Έτσι, ενώ η ερώτηση ρωτά πώς ταξινομούνται, η απάντηση είναι περισσότερο για τις σχέσεις με το περιβάλλον και τις εξελικτικές σχέσεις τους .