Η βάση ή η ρίζα ενός φυλογενετικού δέντρου είναι όπου ο πληθυσμός είτε εξαφανίζεται σήμερα που ζει σήμερα;

Αυτό δεν είναι σωστό. Ενώ η βάση ενός φυλογενετικού δέντρου αντιπροσωπεύει το πιο προγονικό Πληθυσμός, δεν σημαίνει απαραίτητα ότι ο πληθυσμός εξαφανίστηκε ή ζει σήμερα. Εδώ είναι γιατί:

* εξαφάνιση: Η βάση του δέντρου αντιπροσωπεύει τον * κοινό πρόγονο * όλων των οργανισμών στο δέντρο. Αυτός ο πρόγονος μπορεί να έχει εξαφανιστεί εδώ και πολύ καιρό. Ωστόσο, οι απόγονοί του (που εκπροσωπούνται από τους κλάδους του δέντρου) συνέχισαν να εξελίσσονται και να διαφοροποιούνται.

* Τρέχουσα ζωή: Ορισμένα κλαδιά του δέντρου μπορεί να οδηγήσουν σε πληθυσμούς που είναι ακόμα ζωντανοί σήμερα, ενώ άλλοι μπορεί να έχουν εξαφανιστεί σε κάποιο σημείο στην πορεία.

* Η βάση αντιπροσωπεύει ένα χρονικό σημείο: Είναι σημαντικό να θυμόμαστε ότι η βάση ενός φυλογενετικού δέντρου αντιπροσωπεύει ένα συγκεκριμένο χρονικό σημείο - το σημείο όπου όλοι οι οργανισμοί στο δέντρο μοιράστηκαν έναν κοινό πρόγονο. Ο ίδιος ο πρόγονος μπορεί να έχει ζήσει για κάποιο χρονικό διάστημα πριν χωρίσει στις γενεές που αντιπροσωπεύουν τα κλαδιά.

Στην ουσία, η βάση ενός φυλογενετικού δέντρου αντιπροσωπεύει τον κοινό πρόγονο όλων των οργανισμών που περιλαμβάνονται στο δέντρο, αλλά δεν συνεπάγεται κατ 'ανάγκη εξαφάνιση ή τρέχουσα ύπαρξη ούτε για τον πρόγονο ούτε για οποιονδήποτε από τους απογόνους του.