Διαφορά μεταξύ επαναλαμβανόμενου DNA και δορυφορικού DNA

Κύρια διαφορά – Επαναλαμβανόμενο DNA έναντι δορυφορικού DNA

Το επαναλαμβανόμενο DNA και το δορυφορικό DNA είναι δύο τύποι DNA που βρίσκονται στο γονιδίωμα των περισσότερων ευκαρυωτών. Η κύρια διαφορά μεταξύ επαναλαμβανόμενου DNA και δορυφορικού DNA είναι ότιτο επαναλαμβανόμενο DNA είναι μικρές αλληλουχίες DNA που επαναλαμβάνονται εκατοντάδες ή χιλιάδες φορές, ενώ το δορυφορικό DNA είναι εξαιρετικά επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες DNA, που αποτελούν σημαντικό μέρος του γονιδιώματος . Οι δύο τύποι επαναλήψεων που βρίσκονται στο γονιδίωμα είναι οι διαδοχικές επαναλήψεις και οι διάσπαρτες επαναλήψεις. Το δορυφορικό DNA αποτελείται από πολλές διαδοχικές επαναλήψεις μιας μικρής βασικής επαναλαμβανόμενης μονάδας. Βρίσκεται σε συγκεκριμένα χρωμοσώματα του ανθρώπινου γονιδιώματος και κοντά στα κεντρομερή των χρωμοσωμάτων.

Βασικές περιοχές που καλύπτονται

1. Τι είναι το Επαναλαμβανόμενο DNA
     – Ορισμός, Λίπη, Τύποι
2. Τι είναι το δορυφορικό DNA
     – Ορισμός, Γεγονότα, Τύποι
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες ανάμεσα στο επαναλαμβανόμενο DNA και το δορυφορικό DNA
     – Περίληψη κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά ανάμεσα στο επαναλαμβανόμενο DNA και το δορυφορικό DNA
     – Σύγκριση βασικών διαφορών

Βασικοί όροι:Διάσπαρτες επαναλήψεις, μικροδορυφόροι, μικροδορυφόροι, επαναλαμβανόμενο DNA, δορυφορικό DNA, διαδοχικές επαναλήψεις

Τι είναι το Επαναλαμβανόμενο DNA

Το επαναλαμβανόμενο DNA αναφέρεται στα τμήματα του DNA που επαναλαμβάνονται σε όλο το γονιδίωμα. Αντιπροσωπεύει κάποια ποσότητα του μη κωδικοποιητικού DNA που απλώνεται σε όλη την ευχρωματίνη. Η επαναλαμβανόμενη μονάδα μπορεί να αποτελείται από λίγα ζεύγη βάσεων έως εκατοντάδες ζεύγη βάσεων. Το μέσο μέγεθος της επαναλαμβανόμενης μονάδας είναι 300 bp. Μπορεί να επαναληφθεί για 10-10 αντίγραφα ανά γονιδίωμα. Οι δύο κύριοι τύποι επαναλαμβανόμενου DNA είναι οι διαδοχικές επαναλήψεις και οι διάσπαρτες επαναλήψεις. Οι διαδοχικές επαναλήψεις εμφανίζονται στην εικόνα 1 .

Εικόνα 1:Διαδοχικές επαναλήψεις

Στις διαδοχικές επαναλήψεις, τα αντίγραφα μιας μονάδας επαναλαμβανόμενης ακολουθίας βρίσκονται το ένα δίπλα στο άλλο, σχηματίζοντας ένα μπλοκ ή έναν πίνακα. Το δορυφορικό DNA είναι ένας τύπος διαδοχικών επαναλήψεων. Σε διάσπαρτες επαναλήψεις, οι επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες διασκορπίζονται σε όλο το γονιδίωμα ως μεμονωμένες μονάδες που πλαισιώνονται από μοναδική αλληλουχία. Τα μετατιθέμενα στοιχεία, όπως τα τρανσποζόνια DNA και τα ρετροτρανσποζόνια, είναι διάσπαρτες επαναλήψεις.

Τι είναι το Satellite DNA

Το δορυφορικό DNA αναφέρεται σε σύντομες, επαναλαμβανόμενες, αλληλουχίες DNA που βρίσκονται συχνά σε κεντρομερείς περιοχές του γονιδιώματος. Είναι οι κύριες λειτουργικές μονάδες του κεντρομερούς. Το δορυφορικό DNA βρίσκεται επίσης στην ετεροχρωματίνη ως κύριο δομικό συστατικό. Στο ανθρώπινο γονιδίωμα, το δορυφορικό DNA μπορεί να βρεθεί στα χρωμοσώματα 1, 9 και 16 και στους βραχείς βραχίονες των χρωμοσωμάτων 13-15, 21 και 22. Το δορυφορικό DNA είναι ένας τύπος διαδοχικών επαναλήψεων. Αποτελείται από σύντομες αλληλουχίες νουκλεοτιδίων περίπου 60 bp που επαναλαμβάνονται περισσότερες από 10 φορές στο γονιδίωμα. Οι δύο κύριοι τύποι δορυφορικού DNA είναι οι μίνι δορυφόροι και οι μικροδορυφόροι. Μια ακολουθία μίνι δορυφόρου εμφανίζεται στην εικόνα 2 .

Εικόνα 2:Minisatellite DNA

Οι Minisatellites αποτελούνται από 10-60 ζεύγη βάσεων στην επαναλαμβανόμενη μονάδα. Εντοπίζονται σε πολλά σημεία του γονιδιώματος συμπεριλαμβανομένων των κεντρομερών. Οι μικροδορυφόροι αποτελούνται από λιγότερα από 10 ζεύγη βάσεων στην επαναλαμβανόμενη μονάδα και βρίσκονται κυρίως στα τελομερή.

Similarities Between Repetitive DNA and Satellite DNA

• Το επαναλαμβανόμενο DNA και το δορυφορικό DNA είναι δύο τύποι DNA που βρίσκονται στο ευκαρυωτικό γονιδίωμα.
• Τόσο το επαναλαμβανόμενο DNA όσο και το δορυφορικό DNA αποτελούνται από επαναλαμβανόμενες μονάδες αλληλουχίας.
• Τόσο το επαναλαμβανόμενο DNA όσο και το δορυφορικό DNA είναι τύποι μη κωδικοποιητικού DNA.
• Τόσο το επαναλαμβανόμενο DNA όσο και το δορυφορικό DNA δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες.
• Τόσο το επαναλαμβανόμενο DNA όσο και το δορυφορικό DNA βρίσκονται σε διαγονιδιακές περιοχές.
• Τόσο το επαναλαμβανόμενο DNA όσο και το δορυφορικό DNA είναι σημαντικά για τη διατήρηση της δομής του γονιδιώματος.

Διαφορά μεταξύ επαναλαμβανόμενου DNA και δορυφορικού DNA

Ορισμός

Επαναλαμβανόμενο DNA: Το επαναλαμβανόμενο DNA αναφέρεται στα τμήματα του DNA που επαναλαμβάνονται σε όλο το γονιδίωμα.

Δορυφορικό DNA: Το δορυφορικό DNA αναφέρεται στις σύντομες επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες DNA που βρίσκονται συχνά σε κεντρομερείς περιοχές του γονιδιώματος.

Τύποι επαναλαμβανόμενων ακολουθιών

Επαναλαμβανόμενο DNA: Το επαναλαμβανόμενο DNA αποτελείται είτε από διαδοχικές επαναλήψεις είτε από διάσπαρτες επαναλήψεις.

Δορυφορικό DNA: Το δορυφορικό DNA αποτελείται από διαδοχικές επαναλήψεις.

Μέγεθος της επαναλαμβανόμενης μονάδας

Επαναλαμβανόμενο DNA: Το επαναλαμβανόμενο DNA μπορεί να αποτελείται από λίγα ζεύγη βάσεων έως εκατοντάδες ζεύγη βάσεων στην επαναλαμβανόμενη μονάδα.

Δορυφορικό DNA: Το δορυφορικό DNA αποτελείται από μικρές επαναλαμβανόμενες μονάδες (μήκους έως 60 ζεύγη βάσεων).

Βαθμός επανάληψης

Επαναλαμβανόμενο DNA: Το επαναλαμβανόμενο DNA είναι μετρίως επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες (10-10 επαναλήψεις ανά γονιδίωμα).

Δορυφορικό DNA: Το δορυφορικό DNA αποτελείται από εξαιρετικά επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες (>10 επαναλήψεις ανά γονιδίωμα).

Βρίσκεται σε

Επαναλαμβανόμενο DNA: Το επαναλαμβανόμενο DNA βρίσκεται στις διαγονιδιακές περιοχές του γονιδιώματος.

Δορυφορικό DNA: Το δορυφορικό DNA βρίσκεται σε συγκεκριμένα χρωμοσώματα και κεντρομερή των χρωμοσωμάτων.

Τύποι

Επαναλαμβανόμενο DNA: Οι δύο κύριοι τύποι επαναλαμβανόμενου DNA είναι οι διαδοχικές επαναλήψεις και οι διάσπαρτες επαναλήψεις.

Δορυφορικό DNA: Οι δύο κύριοι τύποι δορυφορικού DNA είναι οι μικροδορυφόροι και οι μίνι δορυφόροι.

Ρόλος

Επαναλαμβανόμενο DNA: Το επαναλαμβανόμενο DNA χρησιμεύει ως εξελικτική συσκευή, καταλύοντας το σχηματισμό νέων γονιδίων.

Δορυφορικό DNA: Το δορυφορικό DNA παίζει σημαντικό ρόλο στη λήψη δακτυλικών αποτυπωμάτων DNA.

Σε ανάλυση διαβάθμισης πυκνότητας CsCl

Επαναλαμβανόμενο DNA: Το επαναλαμβανόμενο DNA εμφανίζεται ως φωτεινές ζώνες.

Δορυφορικό DNA: Το δορυφορικό DNA εμφανίζεται ως μικρές σκοτεινές ζώνες.

Συμπέρασμα

Το επαναλαμβανόμενο DNA και το δορυφορικό DNA είναι δύο τύποι επαναλήψεων DNA που βρίσκονται στο γονιδίωμα. Το επαναλαμβανόμενο DNA είναι μετρίως επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες DNA ενώ το δορυφορικό DNA είναι πολύ επαναλαμβανόμενες, σύντομες αλληλουχίες DNA. Η κύρια διαφορά μεταξύ επαναλαμβανόμενου και δορυφορικού DNA είναι ο βαθμός επανάληψης.

Αναφορά:

1.López-Flores, I., and M.A. Garrido-Ramos. "Το επαναλαμβανόμενο περιεχόμενο DNA των ευκαρυωτικών γονιδιωμάτων." Karger Publishers, 25 Ιουνίου 2012, Διαθέσιμο εδώ.
2.Garrido-Ramos, Manuel A. "Satellite DNA:An Evolving Topic." Genes, MDPI, Σεπτ. 2017, Διαθέσιμο εδώ.

Εικόνα Ευγενική προσφορά:

1. "VNTR2individuals5or7repeats" Από Madelyndotson – Ίδια εργασία (CC BY-SA 4.0) μέσω Commons Wikimedia