Διαφορά μεταξύ νιτροκυτταρίνης και νάιλον μεμβράνης

Η κύρια διαφορά μεταξύ της μεμβράνης νιτροκυτταρίνης και νάιλον είναι ότι η μεμβράνη νιτροκυτταρίνης έχει υψηλή συγγένεια για δέσμευση πρωτεϊνών ενώ η μεμβράνη νάιλον έχει υψηλή συγγένεια για σύνδεση νουκλεϊκού οξέος. Επιπλέον, οι υδρόφοβες και ηλεκτροστατικές αλληλεπιδράσεις δεσμεύουν μακρομόρια στις μεμβράνες νιτροκυτταρίνης ενώ οι ιοντικές, υδρόφοβες και ηλεκτροστατικές αλληλεπιδράσεις δεσμεύουν μακρομόρια στις μεμβράνες νάιλον

Η νιτροκυτταρίνη και η νάιλον μεμβράνη είναι δύο τύποι μεμβρανών στις οποίες μεταφέρονται τα μακρομόρια από το πήκτωμα. Ωστόσο, οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη σύνδεση DNA και RNA επίσης.

Βασικές περιοχές που καλύπτονται

1. Τι είναι η μεμβράνη νιτροκυτταρίνης
     – Ορισμός, Δομή, Μηχανισμός Δεσίματος, Πλεονεκτήματα
2. Τι είναι η νάιλον μεμβράνη
     – Ορισμός, Δομή, Μηχανισμός Δεσίματος, Πλεονεκτήματα 
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ νιτροκυτταρίνης και νάιλον μεμβράνης
     – Περίληψη κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ νιτροκυτταρίνης και νάιλον μεμβράνης
     – Σύγκριση βασικών διαφορών

Βασικοί όροι

Συνάφεια, Biodyne A, Biodyne B, νιτροκυτταρίνη, νουκλεϊκά οξέα, νάιλον, μέγεθος πόρων, πρωτεΐνες

Τι είναι η μεμβράνη Nitrocellulose

Η μεμβράνη νιτροκυτταρίνης είναι μια κοινή μήτρα που χρησιμοποιείται στο Western blotting λόγω της υψηλής συγγένειας δέσμευσης πρωτεΐνης. Ωστόσο, μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την ανίχνευση νουκλεϊκών οξέων εκτός από ακινητοποιημένες πρωτεΐνες και γλυκοπρωτεΐνες. Η ακινητοποίηση των μακρομορίων γίνεται κυρίως μέσω υδρόφοβων αλληλεπιδράσεων. Σχηματίζονται επίσης δεσμοί υδρογόνου μεταξύ των νιτροομάδων της μεμβράνης και των πλευρικών αλυσίδων αμινοξέων των πρωτεϊνών. Η ακινητοποίηση της πρωτεΐνης θα είναι υψηλή στις υψηλές συγκεντρώσεις αλατιού και χαμηλές συγκεντρώσεις μεθανόλης.

Εικόνα 1:Αρχή του Blot

Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης είναι διαθέσιμες σε 100% καθαρές μορφές νιτροκυτταρίνης με μεγάλη επιφάνεια, η οποία είναι ομοιόμορφη. Τα διαθέσιμα προμεγέθη είναι 0,2 μm και 0,45 μm. Το μικρό μέγεθος πόρων είναι καλύτερο για τη σύνδεση με μικρές πρωτεΐνες (<14 kDa). Η ικανότητα δέσμευσης και συγκράτησης των πρωτεϊνών είναι 80-250 μg/cm. Οι προσυναρμολογημένες μεμβράνες είναι έτοιμες για χρήση. Ένα από τα κύρια πλεονεκτήματα των μεμβρανών νιτροκυτταρίνης είναι το πολύ χαμηλό υπόβαθρό τους καθώς μπορεί εύκολα να μπλοκαριστεί. Οι υποστηριζόμενες μεμβράνες νιτροκυτταρίνης μπορούν να απογυμνωθούν και να ανιχνευτούν ξανά.

Τι είναι η Nylon Membrane

Η νάιλον μεμβράνη είναι μια ευρέως χρησιμοποιούμενη μήτρα για τη δέσμευση νουκλεϊκών οξέων. Οι μεμβράνες από νάιλον είναι μηχανικά ισχυρές από τις μεμβράνες νιτροκυτταρίνης. Οι δύο κύριοι τύποι μεμβρανών νάιλον που χρησιμοποιούνται στη στύπωση είναι το Biodyne A και το Biodyne B. Το μέγεθος πόρων και των δύο τύπων είναι 0,45 μm. Είναι ανθεκτικά στη θερμότητα και τους διαλύτες. Επίσης, δεν θα συρρικνωθούν, δεν θα ραγίσουν ή θα σχιστούν. Και οι δύο δίνουν χαμηλό υπόβαθρο από τις μεμβράνες νιτροκυτταρίνης.

Εικόνα 2:Μεμβράνη Southern Blot

• Biodyne A αποτελείται από μη τροποποιημένο νάιλον 66. Η υψηλή ευαισθησία και η εξαιρετική ανάλυση είναι τα οφέλη του Biodyne A. Δεδομένου ότι το Biodyne A περιέχει θετικά και αρνητικά φορτία, μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη δέσμευση πολλών τύπων μακρομορίων.
• Biodyne B αποτελείται από θετικά φορτισμένο νάιλον 66. Επομένως, έχει εξαιρετική ικανότητα δέσμευσης για αρνητικά φορτισμένα νουκλεϊκά οξέα όπως το DNA και το RNA.

Ομοιότητες μεταξύ Nitrocellulose and Nylon Membrane

• Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης και νάιλον είναι δύο τύποι μεμβρανών που χρησιμοποιούνται για τη μεταφορά μακρομορίων από το πήκτωμα σε τεχνικές στύπωσης.
• Επιτρέπουν την ανίχνευση μακρομορίων στη μεμβράνη.
• Μπορούν να χρησιμοποιηθούν και οι δύο τύποι μεμβρανών για τη μεταφορά νουκλεϊκών οξέων.
• Μπορούν να απογυμνωθούν και να δοκιμαστούν ξανά.

Διαφορά μεταξύ νιτροκυτταρίνης και νάιλον μεμβράνης

Ορισμός

Η μεμβράνη νιτροκυτταρίνης αναφέρεται σε μια κολλώδη μεμβράνη που χρησιμοποιείται για την ακινητοποίηση νουκλεϊκών οξέων και πρωτεϊνών στο στύπωμα, ενώ η μεμβράνη νάιλον αναφέρεται σε έναν τύπο μεμβράνης με υψηλή αντοχή και αντοχή στη θερμότητα που χρησιμοποιείται για την ακινητοποίηση μακρομορίων.

Αποτελείται από

Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης αποτελούνται από νιτρωμένη κυτταρίνη ενώ οι νάιλον μεμβράνες αποτελούνται από μη τροποποιημένο ή θετικά φορτισμένο νάιλον Biodyne A και Biodyne B.

Μέγεθος πόρων

Τα μεγέθη πόρων των μεμβρανών νιτροκυτταρίνης είναι 0,2 μm και 0,45 μm ενώ το μέγεθος πόρων των μεμβρανών από νάιλον είναι 0,45 μm.

Δύναμη

Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης είναι εύθραυστες και επομένως δεν μπορούν να επαναχρησιμοποιηθούν ενώ οι μεμβράνες από νάιλον είναι μηχανικά ισχυρές.

Μέθοδος μεταφοράς

Η ηλεκτροφορητική μεταφορά χρησιμοποιείται κυρίως στη μεταφορά πρωτεϊνών στις μεμβράνες νιτροκυτταρίνης, ενώ η τριχοειδική μεταφορά είναι η κοινή πρακτική με τις μεμβράνες από νάιλον.

Συγγένεια

Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης έχουν υψηλή συγγένεια με την πρωτεΐνη, ενώ οι μεμβράνες από νάιλον έχουν υψηλή συγγένεια με τα νουκλεϊκά οξέα. Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν για νουκλεϊκά οξέα.

Αποτύπωση

Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης είναι καλύτερες για Western blotting ενώ οι μεμβράνες νάιλον είναι καλύτερες για Southern και Northern Blotting.

Αλληλεπιδράσεις σύνδεσης

Οι υδρόφοβες και οι ηλεκτροστατικές αλληλεπιδράσεις δεσμεύουν μακρομόρια στις μεμβράνες νιτροκυτταρίνης ενώ οι ιοντικές, υδρόφοβες και ηλεκτροστατικές αλληλεπιδράσεις δεσμεύουν μακρομόρια στις μεμβράνες νάιλον.

Ικανότητα δέσμευσης πρωτεϊνών

Η ικανότητα δέσμευσης πρωτεϊνών της μεμβράνης νιτροκυτταρίνης είναι 80-250 μg/cm, ενώ η ικανότητα δέσμευσης πρωτεΐνης της μεμβράνης νάιλον είναι 150-200 μg/cm.

Συμπέρασμα

Η μεμβράνη νιτροκυτταρίνης είναι μια εύθραυστη μεμβράνη που χρησιμοποιείται κυρίως για την ακινητοποίηση πρωτεΐνης στο Western blotting ενώ η μεμβράνη νάιλον είναι μια ισχυρή μεμβράνη που χρησιμοποιείται κυρίως για την ακινητοποίηση νουκλεϊκών οξέων. Οι μεμβράνες νιτροκυτταρίνης δεσμεύουν μόρια μέσω υδρόφοβων αλληλεπιδράσεων ενώ οι μεμβράνες νάιλον δεσμεύουν μόρια μέσω ηλεκτροστατικών αλληλεπιδράσεων. Επομένως, η κύρια διαφορά μεταξύ νιτροκυτταρίνης και νάιλον μεμβράνης είναι η συγγένεια.

Αναφορά:

1. «Μεμβράνες νιτροκυτταρίνης για Western Blotting | Thermo Fisher Scientific – LK.” Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, Διαθέσιμο εδώ
2. “Biodyne A Nylon Membrane, 0,45 m, 8 cm x 12 cm.” Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, Διαθέσιμο εδώ
3. “Biodyne B Nylon Membrane, 0,45 m, 8 cm x 12 cm.” Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, Διαθέσιμο εδώ

Εικόνα Ευγενική προσφορά:

1. "Blot biology" By Gbdivers – Ίδια εργασία (CC BY-SA 3.0) μέσω Commons Wikimedia
2. "Southern blot membrane" Του Bojan Žunar – Δική του δουλειά (CC BY-SA 4.0) μέσω Commons Wikimedia