Πώς εξελίχθηκε η σύνθετη ζωή; Η απάντηση θα μπορούσε να είναι μέσα
Ωστόσο, υπάρχουν δύο σημαντικά προβλήματα με αυτήν την παραδοσιακή θεωρία:
1- Τα απολιθωμένα στοιχεία δείχνουν ότι η σύνθετη ζωή δεν σχηματίστηκε με αυτόν τον τρόπο. Οι οργανισμοί εμφανίζονται ξαφνικά στο ορυκτό ρεκόρ - ήδη πολύπλοκες.
Ο 2 Δαρβινικός ανταγωνισμός μεταξύ των ειδών δεν θα μπορούσε να αποτελέσει τον μοναδικό οδηγό της εξέλιξης της πολυπλοκότητας, καθώς ήταν ο ανταγωνισμός μέσα σε είδη - καθώς και η συνεργασία των κυττάρων τους - που διευκόλυνε την εξέλιξη της πολυπλοκότητας.
Μια θεωρία της εξέλιξης της πολυπλοκότητας ξεπερνά αυτά τα προβλήματα.
Η ιδέα μιας εξέλιξης της βιολογικής πολυπλοκότητας υποδηλώνει ότι τα ίδια τα γονιδιώματα μπορούν να υποβληθούν σε εξέλιξη πολυπλοκότητας.
Περιλαμβάνει τον ανταγωνισμό και τη συνεργασία μεταξύ εγωιστικών γενετικών στοιχείων μέσα στο γονιδίωμα και όχι μεταξύ των ειδών.
για παράδειγμα, Τα τρανσποζόνια είναι επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες DNA που μπορούν να κινηθούν μέσα σε ένα γονιδίωμα. Τα τρανσποζόνια μπορούν να προσφέρουν ευεργετικές και επιβλαβείς επιδράσεις στο γονιδίωμα, συμβάλλοντας στην εξέλιξη.
Επιπλέον, τα γονιδιώματα είναι πολύπλοκα συστήματα που αυτο-οργανώνουν και δημιουργούν νέες γενετικές και επιγενετικές αλλαγές. Αυτές οι αλλαγές δημιουργούν νέους φαινότυπους, οι οποίοι μπορούν να υποβληθούν σε φυσική επιλογή σε επίπεδο οργανισμού. Αυτός ο μηχανισμός εσωτερικού χώρου προσφέρει μια πιο ολοκληρωμένη εξήγηση για την εξελικτική προέλευση των σύνθετων βιολογικών συστημάτων.