Η συναρμολόγηση γονιδιώματος του γαϊδουριού αποκαλύπτει ενδείξεις για το πώς μπορεί να έχει διακλαδιστεί από το άλογο
Οι ερευνητές δημιούργησαν ένα συγκρότημα γονιδιώματος υψηλής ποιότητας ενός αρσενικού γαϊδουριού χρησιμοποιώντας ένα συνδυασμό τεχνολογιών αλληλουχίας μακράς ανάγνωσης και αλληλουχίας βραχείας ανάγνωσης. Συγκρίνοντας το γονιδίωμα γαϊδουριών με εκείνα των αλόγων και των ζέβρων, η ομάδα εντόπισε βασικές γονιδιωματικές διαφορές που μπορεί να συνέβαλαν στα μοναδικά χαρακτηριστικά και τις προσαρμογές αυτών των ειδών.
Τα γαϊδούρια και τα άλογα, τα οποία ανήκουν στο ίδιο γένος Equus, αποκλίνουν από έναν κοινό πρόγονο περίπου 4,5 εκατομμύρια χρόνια πριν. Οι ερευνητές διαπίστωσαν ότι το γονιδίωμα του γαϊδάρου έχει υποβληθεί σε σημαντικές χρωμοσωμικές αναδιατάξεις και γονιδιακές οικογενειακές επεκτάσεις σε σύγκριση με το γονιδίωμα του αλόγου. Αυτές οι γονιδιωματικές αλλαγές μπορεί να έχουν διαδραματίσει κάποιο ρόλο στην απόκλιση των γαϊδουριών και των αλόγων και την προσαρμογή τους σε διαφορετικά περιβάλλοντα.
Για παράδειγμα, το γονιδίωμα του γαϊδουριού έδειξε μια επέκταση των γονιδιακών οικογενειών που εμπλέκονται στην ανοσοαπόκριση και την πέψη, η οποία μπορεί να συνέβαλε στην ικανότητα του γαϊδουριού να επιβιώσει σε σκληρά και περιορισμένα από πόρους περιβάλλοντα. Η μελέτη αποκάλυψε επίσης ότι το γονιδίωμα του γαϊδουριού περιέχει ένα υψηλότερο ποσοστό επαναλαμβανόμενων στοιχείων, συμπεριλαμβανομένων των μεταφερόμενων στοιχείων, σε σύγκριση με το γονιδίωμα του αλόγου. Αυτά τα επαναλαμβανόμενα στοιχεία μπορεί να έχουν διαδραματίσει κάποιο ρόλο στην εξέλιξη και την προσαρμογή του γονιδιώματος.
Οι ερευνητές εντόπισαν επίσης αρκετές γονιδιωματικές περιοχές που μπορεί να σχετίζονται με συγκεκριμένα χαρακτηριστικά σε γαϊδούρια, όπως το μικρότερο μέγεθος του σώματος και η ικανότητά τους να φέρουν βαριά φορτία. Αυτές οι περιοχές περιέχουν γονίδια που εμπλέκονται στη σκελετική ανάπτυξη, τη λειτουργία των μυών και τον μεταβολισμό. Απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για να διερευνηθούν οι λειτουργικοί ρόλοι αυτών των γονιδίων και η συμβολή τους στα μοναδικά χαρακτηριστικά των γαϊδουριών.
Η συγκρότηση γονιδιώματος υψηλής ποιότητας του γαϊδουριού παρέχει έναν πολύτιμο πόρο για μελλοντική έρευνα σχετικά με την εξέλιξη, τη γενετική και τη βιολογία αυτού του είδους. Έχει επίσης πιθανές επιπτώσεις στην κατανόηση της γενετικής βάσης σημαντικών χαρακτηριστικών στα γαϊδούρια, τα οποία θα μπορούσαν να είναι χρήσιμα για επιλεκτικές προσπάθειες αναπαραγωγής και διατήρησης.
