Οι ερευνητές περιγράφουν τον τρόπο με τον οποίο οι επικαλύψεις των τμημάτων DNA επηρεάζουν το γονιδίωμα 3-D δομής
Ένα κοινό αποτέλεσμα είναι ο σχηματισμός επαναλαμβανόμενων τομέων, οι οποίες είναι περιοχές του γονιδιώματος που περιέχουν πολλαπλά αντίγραφα της ίδιας αλληλουχίας DNA. Η επανάληψη τομέων μπορεί να κυμαίνεται σε μέγεθος από μερικές εκατοντάδες ζεύγη βάσεων σε αρκετές megabases και μπορούν να βρεθούν τόσο σε κωδικοποιητικές όσο και σε μη κωδικοποιητικές περιοχές του γονιδιώματος.
Η επανάληψη των τομέων μπορεί να έχει διάφορες λειτουργίες, όπως:
* Παροχή δομικής υποστήριξης για το γονιδίωμα
* Ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης
* Διαμεσολάβηση ζευγαρώματος χρωμοσωμάτων κατά τη διάρκεια της μείωσης
Μια άλλη κοινή επίδραση των αλληλοεπικαλύψεων του τμήματος DNA είναι ο σχηματισμός των παλινδρομικών, οι οποίες είναι αλληλουχίες DNA που διαβάζουν τα ίδια προς τα πίσω και προς τα εμπρός. Τα Palindromes μπορούν να σχηματίσουν όταν δύο αντίγραφα του ίδιου τμήματος DNA είναι ανεστραμμένα και εισάγονται δίπλα στο άλλο. Τα Palindromes μπορούν να έχουν μια ποικιλία διαφορετικών λειτουργιών, όπως:
* Παρέχοντας θέσεις για τη δέσμευση πρωτεϊνών που εμπλέκονται στην επισκευή και ανασυνδυασμό του DNA
* Διαμεσολάβηση του σχηματισμού σταυροειδών δομών, οι οποίες είναι δομές DNA που μοιάζουν με ένα σταυρό
* Προώθηση του σχηματισμού φουρκέτων DNA, οι οποίες είναι δομές DNA που μοιάζουν με στροφή φουρκέτας
Εκτός από τη διαμόρφωση επαναλαμβανόμενων τομέων και παλινδρομικών, οι επικαλύψεις του τμήματος DNA μπορούν επίσης να οδηγήσουν στο σχηματισμό άλλων τύπων διαρθρωτικών παραλλαγών, όπως διαγραφές, εισαγωγές και αναστροφές. Αυτές οι διαρθρωτικές παραλλαγές μπορούν να έχουν μια ποικιλία επιδράσεων στο γονιδίωμα, συμπεριλαμβανομένου:
* Διαταραχή της γονιδιακής λειτουργίας
* Προκαλώντας γενετικές παθήσεις
* Προώθηση της εξέλιξης των νέων γονιδίων
Συνολικά, οι επικαλύψεις του τμήματος DNA μπορούν να έχουν σημαντικό αντίκτυπο στη δομή 3-D του γονιδιώματος. Αυτές οι δομικές παραλλαγές μπορούν να έχουν μια ποικιλία διαφορετικών λειτουργιών και μπορούν να διαδραματίσουν ρόλο τόσο σε φυσιολογικές όσο και σε μη φυσιολογικές κυτταρικές διεργασίες.
