Οι επιστήμονες αποκαλύπτουν πώς διαφεύγει το φωσφορικό από νήματα ακτίνης
Η μελέτη, με επικεφαλής τους ερευνητές του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνιας του Σαν Φρανσίσκο, χρησιμοποίησε συνδυασμό πειραματικών και υπολογιστικών τεχνικών για τη διερεύνηση της δυναμικής απελευθέρωσης φωσφορικών. Η ομάδα επικεντρώθηκε σε μια συγκεκριμένη περιοχή του νήματος ακτίνης που είναι γνωστή ως "τσέπη δέσμευσης νουκλεοτιδίων", όπου συμβαίνει η υδρόλυση φωσφορικού άλατος, η διάσπαση των φωσφορικών δεσμών.
Χρησιμοποιώντας μικροσκοπία ατομικής δύναμης υψηλής ταχύτητας, οι ερευνητές ήταν σε θέση να απεικονίσουν άμεσα το γεγονός απελευθέρωσης φωσφορικών σε πραγματικό χρόνο. Παρατήρησαν ότι η διαφυγή φωσφορικού άλατος εμφανίζεται μέσω ενός παροδικού ανοίγματος της τσέπης δέσμευσης νουκλεοτιδίων, επιτρέποντας στη φωσφορική ομάδα να αποσυνδεθεί από το νήμα ακτίνης. Αυτή η κίνηση ανοίγματος και κλεισίματος βρέθηκε να διευκολύνεται από την κίνηση μιας δομής κοντινού βρόχου εντός του μορίου ακτίνης.
Για να διασαφηνιστούν περαιτέρω οι μοριακές λεπτομέρειες αυτής της διαδικασίας, οι ερευνητές διεξήγαγαν υπολογιστικές προσομοιώσεις. Αυτές οι προσομοιώσεις αποκάλυψαν ότι η απελευθέρωση φωσφορικού άλας επηρεάζεται από διάφορους παράγοντες, συμπεριλαμβανομένου του τοπικού ηλεκτροστατικού περιβάλλοντος και της ευελιξίας της τσέπης δέσμευσης νουκλεοτιδίων. Οι προσομοιώσεις παρείχαν επίσης πληροφορίες για τους ενεργειακούς φραγμούς που εμπλέκονται στη διαδικασία διαφυγής φωσφορικών και το ρόλο των γειτονικών υπομονάδων ακτίνης στη σταθεροποίηση των μεταβατικών καταστάσεων.
Τα ευρήματα αυτής της μελέτης παρέχουν μια βαθύτερη κατανόηση των μοριακών μηχανισμών που βασίζονται στη φωσφορική απελευθέρωση από νήματα ακτίνης. Αυτή η γνώση είναι ζωτικής σημασίας για την κατανόηση της δυναμικής συμπεριφοράς των νηματίων ακτίνης και της συμμετοχής τους σε κυτταρικές διεργασίες όπως η συστολή των μυών, η κυτταρική διαίρεση και η κυτταρική κινητικότητα. Επιπλέον, η μελέτη ανοίγει νέες οδούς για την εξερεύνηση θεραπευτικών παρεμβάσεων που στοχεύουν τις διαδικασίες που βασίζονται σε ακτίνη σε διάφορες ασθένειες, συμπεριλαμβανομένων των μυϊκών διαταραχών και του καρκίνου.