Ποιος είναι ο σκοπός του αλατιού στην εκχύλιση DNA;
1. Κατακρήμνιση DNA:
* Το αλάτι (τυπικά NaCl) εξουδετερώνει τις αρνητικές φορτίσεις στη φωσφορική ραχοκοκαλιά του DNA.
* Τα μόρια DNA έχουν ισχυρό αρνητικό φορτίο λόγω των φωσφορικών ομάδων.
* Η εξουδετέρωση αυτών των φορτίων μειώνει την απόρριψη μεταξύ των μορίων ϋΝΑ, επιτρέποντάς τους να συσσωματώσουν και να κατακρημνίζουν εκτός διαλύματος.
* Αυτό το βήμα καθίζησης βοηθά να διαχωρίσει το DNA από άλλα κυτταρικά συστατικά.
2. Κυτταρική λύση:
* Το αλάτι μπορεί να συμβάλει στη λύση των κυττάρων (σπάσιμο των κυτταρικών μεμβρανών) σε ορισμένα πρωτόκολλα εκχύλισης.
* Μπορεί να διαταράξει την ακεραιότητα των κυτταρικών μεμβρανών, καθιστώντας ευκολότερη την απελευθέρωση του DNA από τα κύτταρα.
3. Σταθεροποίηση του DNA:
* Το αλάτι βοηθά στη σταθεροποίηση του μορίου DNA αλληλεπιδρώντας με τις φωσφορικές ομάδες, μειώνοντας την τάση τους να υποβαθμιστούν.
4. Βελτιωμένη δέσμευση DNA σε στήλες πυριτίας (σε μερικές μεθόδους):
* Σε μερικές μεθόδους εκχύλισης DNA χρησιμοποιώντας στήλες πυριτίας, το αλάτι βοηθά το DNA να δεσμεύεται πιο αποτελεσματικά στη μεμβράνη του πυριτίου. Αυτό βελτιώνει την αποτελεσματικότητα της διαδικασίας εξαγωγής.
5. Πρόληψη της αποικοδόμησης RNA:
* Σε ορισμένες περιπτώσεις, το άλας μπορεί να βοηθήσει στην πρόληψη της αποικοδόμησης του RNA αναστέλλοντας τη δραστικότητα των RNases (ένζυμα αποικοδόμησης RNA).
Συνολικά, το αλάτι στην εκχύλιση DNA βοηθά κυρίως:
* Ξεχωριστό DNA από άλλα κυτταρικά συστατικά.
* Σταθετήστε το μόριο DNA.
* Βελτιώστε την αποτελεσματικότητα της δέσμευσης DNA σε στήλες διοξειδίου του πυριτίου (σε ορισμένες μεθόδους).
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι ο ακριβής ρόλος του αλατιού στην εκχύλιση DNA μπορεί να ποικίλει ανάλογα με το συγκεκριμένο πρωτόκολλο που χρησιμοποιείται.
