Η πιο σημαντική θεωρία για τη χημική εξέλιξη υποδηλώνει ότι τα πρώτα κύτταρα προέκυψαν από απλά σάκους βιολογικών μορίων που ονομάζονται τι;
Τα πρωτόκολλα είναι υποθετικές δομές που πιστεύεται ότι ήταν οι πρόδρομοι των σύγχρονων κυττάρων. Πιστεύεται ότι έχουν σχηματιστεί από την αυτοσυναρμολόγηση των οργανικών μορίων σε μια πρωταρχική σούπα και θα ήταν σε θέση να περικλείουν και να συγκεντρώσουν αυτά τα μόρια, επιτρέποντας την ανάπτυξη των πρώτων μεταβολικών διεργασιών.
Ενώ οι ακριβείς λεπτομέρειες του σχηματισμού πρωτοκέλης εξακολουθούν να βρίσκονται υπό συζήτηση, η έννοια των πρωτοκολών αποτελεί βασικό στοιχείο της θεωρίας της χημικής εξέλιξης.