Είναι δυνατόν να υπάρχει ένα μεταλλαγμένο φυτό νοκ -άουτ που δεν παρουσιάζει ορατό φαινότυπο είναι διαφορετικό από το φυτό άγριου τύπου;
* πλεονασμός: Τα φυτά συχνά έχουν πολλαπλά γονίδια που εκτελούν παρόμοιες λειτουργίες. Εάν ένα γονίδιο χτυπηθεί έξω, ένα άλλο γονίδιο μπορεί να αναλάβει το ρόλο του, καλύπτοντας την επίδραση της μετάλλαξης. Αυτό είναι γνωστό ως γενετική απόλυση.
* Εφέ υπό όρους: Η μετάλλαξη μπορεί να έχει μόνο αποτέλεσμα σε συγκεκριμένες περιβαλλοντικές συνθήκες (π.χ. άγχος, ανεπάρκεια θρεπτικών ουσιών, ειδικές θερμοκρασίες). Σε κανονικές συνθήκες, το φυτό μπορεί να φαίνεται πανομοιότυπο με τον άγριο τύπο.
* Λεπτά φαινότυπα: Η μετάλλαξη μπορεί να προκαλέσει αλλαγή σε μια φυσιολογική διαδικασία που δεν είναι εύκολα ορατή με γυμνό μάτι. Αυτό θα μπορούσε να περιλαμβάνει αλλαγές στον μεταβολισμό, τα επίπεδα των ορμονών ή την έκφραση γονιδίων.
* Ατελές νοκ -άουτ: Το knockout μπορεί να μην εξαλείψει πλήρως τη λειτουργία του γονιδίου. Μπορεί να εξακολουθεί να υπάρχει κάποια υπολειμματική δραστηριότητα, ή το γονίδιο μπορεί να χτυπηθεί εν μέρει, οδηγώντας σε λιγότερο σοβαρό αποτέλεσμα.
* Αναπτυξιακό στάδιο: Ο φαινότυπος μπορεί να είναι ορατός μόνο σε ένα συγκεκριμένο αναπτυξιακό στάδιο. Για παράδειγμα, η μετάλλαξη μπορεί να επηρεάσει τη βλάστηση των σπόρων, αλλά να μην έχει ορατή επίδραση στα φυτά ενηλίκων.
Πώς να ανιχνεύσετε κρυμμένα φαινότυπα:
Ακόμη και αν ένα μεταλλαγμένο νοκ -άουτ δεν εμφανίζει έναν ορατό φαινότυπο, είναι δυνατόν να ανιχνεύσουμε αλλαγές στο μοριακό επίπεδο χρησιμοποιώντας διάφορες τεχνικές:
* Ανάλυση γονιδιακής έκφρασης: Η αλληλουχία RNA ή το qPCR μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να προσδιοριστεί εάν η έκφραση άλλων γονιδίων μεταβάλλεται στο μεταλλάκτη.
* Ανάλυση πρωτεΐνης: Η κηλίδωση Western ή άλλες τεχνικές μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη μέτρηση των επιπέδων πρωτεϊνών και της δραστηριότητάς τους.
* βιοχημικές δοκιμασίες: Αυτά μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη μέτρηση των μεταβολών στις μεταβολικές οδούς ή στην ενζυμική δραστηριότητα.
* Φυσιολογικές μελέτες: Η ανάλυση της ανταπόκρισης του φυτού σε συγκεκριμένα ερεθίσματα (π.χ. άγχος, φως, θρεπτικά συστατικά) μπορεί να αποκαλύψει λεπτές διαφορές μεταξύ του μεταλλαγμένου και του άγριου τύπου.
Συμπερασματικά: Ενώ ένα μεταλλαγμένο νοκ -άουτ μπορεί να φαίνεται πανομοιότυπο με τον άγριο τύπο, δεν σημαίνει ότι δεν υπάρχουν αλλαγές. Περαιτέρω έρευνες είναι συχνά απαραίτητες για να αποκαλύψουν κρυμμένους φαινότυπους και να κατανοηθούν πλήρως οι συνέπειες του γονιδιακού νοκ -άουτ.
