Ποια προκαρυωτική ομάδα συνδέεται περισσότερο με τους ευκαρυώτες;
Εδώ είναι γιατί:
* κοινόχρηστα χαρακτηριστικά: Οι Archaea και οι ευκαρυώτες μοιράζονται αρκετά μοναδικά χαρακτηριστικά που δεν βρίσκονται στα βακτήρια, όπως:
* Παρόμοιες δομές γονιδίων και μηχανισμούς μεταγραφής
* Παρόμοιες δομές ριβοσώματος
* Η παρουσία πρωτεϊνών τύπου ιστόνης που βοηθούν στην οργάνωση του DNA
* Η χρήση παρόμοιων λιπιδίων μεμβράνης
* Φυλογενετικά στοιχεία: Οι μοριακές φυλογενετικές μελέτες, ιδιαίτερα εκείνες που αναλύουν τις αλληλουχίες ριβοσωμικών RNA, υποστηρίζουν έντονα την ιδέα ότι οι Archaea και Eukarya μοιράζονται έναν κοινό πρόγονο, σχηματίζοντας ένα clade που ονομάζεται "tokaryotes" .
Ενώ τα βακτήρια μοιράζονται επίσης κάποιες ομοιότητες με τους ευκαρυώτες, έχουν μια θεμελιωδώς διαφορετική εξελικτική ιστορία. Η στενή σχέση μεταξύ Archaea και Eukarya υποστηρίζεται από ένα τεράστιο ποσό επιστημονικών στοιχείων και είναι ευρέως αποδεκτή στην επιστημονική κοινότητα.