Γιατί η πολυμεράση DNA συνθέτει ένα νέο σκέλος χωρίς το Primer RNA βοήθειας;
* Η πολυμεράση ϋΝΑ χρειάζεται μια ομάδα υδροξυλίου 3 ': Η ϋΝΑ πολυμεράση μπορεί να προσθέσει μόνο νουκλεοτίδια σε ένα υπάρχον κλώνο DNA που έχει ελεύθερη ομάδα υδροξυλίου 3 '. Αυτό είναι το σημείο εκκίνησης για τη δραστηριότητα του ενζύμου.
* Οι εκκινητές RNA παρέχουν την 3 'υδροξυλομάδα: Οι εκκινητές RNA είναι μικρές αλληλουχίες νουκλεοτιδίων RNA που συντίθενται από ένα ένζυμο που ονομάζεται primase. Αυτοί οι εκκινητές παρέχουν την απαραίτητη 3 'υδροξυλομάδα που πρέπει να αρχίσει να προσθέτει νουκλεοτίδια.
* Η σύνθεση de novo είναι αδύνατη: Η ϋΝΑ πολυμεράση δεν μπορεί να ξεκινήσει τη σύνθεση του DNA από την αρχή (de novo). Χρειάζεται ένα προϋπάρχον πρότυπο για να ακολουθήσει και μια ελεύθερη ομάδα υδροξυλίου 3 'για να αρχίσει να προσθέτει νουκλεοτίδια.
Συνοπτικά:
Η ϋΝΑ πολυμεράση απαιτεί ένα εκκινητή RNA για να ξεκινήσει τη σύνθεση του DNA επειδή δεν μπορεί να αρχίσει να προσθέτει νουκλεοτίδια χωρίς προϋπάρχουσα 3 'υδροξυλομάδα 3'. Ο εκκινητής RNA παρέχει αυτή την ομάδα, επιτρέποντας στην πολυμεράση DNA να αρχίσει να κατασκευάζει το νέο κλώνο DNA.
