Ποιοι είναι οι διαφορετικοί τύποι πολυμεράσων RNA και οι προαγωγοί τους;

Τύποι πολυμεράσων RNA και τους προαγωγούς τους

Οι πολυμεράσες RNA είναι ένζυμα που είναι υπεύθυνα για τη μεταγραφή του DNA σε RNA. Διαφορετικοί τύποι πολυμεράσων RNA υπάρχουν σε ευκαρυώτες και προκαρυωτικά, το καθένα με τις συγκεκριμένες λειτουργίες και τις αλληλουχίες αναγνώρισης προαγωγού.

προκαρυωτικά:

* RNA πολυμεράση (RNAP) :Η μονή RNA πολυμεράση σε προκαρυωτικά μεταγράφει όλους τους τύπους RNA (mRNA, tRNA, rRNA).

* Δομή προαγωγού:

* -10 στοιχείο (πλαίσιο pribnow): Η ακολουθία TATAAT βρίσκεται περίπου 10 ζεύγη βάσεων ανάντη από την τοποθεσία έναρξης της μεταγραφής.

* -35 Στοιχείο: Η ακολουθία TTGACA βρίσκεται περίπου 35 ζεύγη βάσεων ανάντη από τη θέση έναρξης της μεταγραφής.

* Αναπληρωτικά στοιχεία: Μερικοί υποψήφιοι έχουν επιπλέον στοιχεία περαιτέρω ανάντη, επηρεάζοντας την αποτελεσματικότητα της μεταγραφής.

ευκαρυώτες:

* RNA πολυμεράση Ι (Pol I): Υπεύθυνος για τη μεταγραφή γονιδίων ριβοσωμικού RNA (rRNA).

* Δομή προαγωγού:

* Core Propter: Μια περιοχή που περιέχει ένα στοιχείο πυρήνα και ένα ανάντη στοιχείο ελέγχου (UCE).

* Στοιχείο πυρήνα: Μια σύντομη ακολουθία που βρίσκεται περίπου 40 bp ανάντη της θέσης έναρξης της μεταγραφής.

* uce: Μια περιοχή που βρίσκεται περίπου 100 bp ανάντη της θέσης έναρξης της μεταγραφής, που συχνά περιέχει μια διατηρημένη ακολουθία που ονομάζεται "ανάντη στοιχείο" (UE).

* RNA πολυμεράση II (Pol II): Μεταγράφει γονίδια κωδικοποίησης πρωτεΐνης (mRNA) και μερικά μικρά γονίδια πυρηνικού RNA (snRNA).

* Δομή προαγωγέα:

* Core Propter: Συνήθως περιέχει τα ακόλουθα στοιχεία:

* Πλαίσιο Tata: Μια διατηρημένη ακολουθία που βρίσκεται περίπου 25-30 bp ανάντη της θέσης έναρξης της μεταγραφής.

* initiator (INR): Μια ακολουθία που βρίσκεται γύρω από την τοποθεσία έναρξης της μεταγραφής.

* Στοιχείο προαγωγού κατάντη (DPE): Βρίσκεται κατάντη της θέσης έναρξης της μεταγραφής.

* BRE (στοιχείο αναγνώρισης TFIIB): Μια ακολουθία που βρίσκεται ανάντη του κιβωτίου TATA, που αναγνωρίζεται από τον παράγοντα μεταγραφής IIB (TFIIB).

* Ανοδικά ρυθμιστικά στοιχεία: Αυτά τα στοιχεία μπορούν να εντοπιστούν εκατοντάδες ή ακόμα και χιλιάδες ζεύγη βάσεων ανάντη του προαγωγού πυρήνα και να επηρεάσουν τον ρυθμό μεταγραφής. Παραδείγματα περιλαμβάνουν:

* κουτί CAAT: Μια ακολουθία συναίνεσης που δεσμεύει τους παράγοντες μεταγραφής.

* Πλαίσιο GC: Μια πλούσια σε GC αλληλουχία που αναγνωρίζεται από παράγοντες μεταγραφής.

* ενισχυτές: Οι αλληλουχίες DNA που μπορούν να διεγείρουν τη μεταγραφή, που συχνά βρίσκονται μακριά από τον προαγωγό πυρήνα.

* RNA πολυμεράση III (Pol III): Μεταγράφει το RNA μεταφοράς (tRNA), 5S ριβοσωμικό RNA (5S rRNA) και μερικά μικρά γονίδια πυρηνικού RNA (snRNA).

* Δομή προαγωγού:

* Εσωτερικός υποκινητής: Βρίσκεται εντός της μεταγραφόμενης περιοχής για γονίδια TRNA και 5S rRNA.

* Προαγωγός ανάντη: Βρίσκεται ανάντη της μεταγραφόμενης περιοχής για ορισμένα γονίδια snRNA.

Πίνακας Περίληψη:

| RNA πολυμεράση | Μεταγραφές | Προωθητές |

| --- | --- | --- |

| Προκαρυωτικό RNAP | mRNA, tRNA, rRNA | -10 Στοιχείο, -35 Στοιχείο, Άνθρωποι Στοιχεία |

| Ευκαρυωτικό pol i | rRNA | Core Propter, UCE |

| Ευκαρυωτικό Pol II | mRNA, κάποιο snRNA | Core Proderer (Tata Box, INR, DPE, BRE), ανάντη ρυθμιστικά στοιχεία |

| Ευκαρυωτικό Pol III | tRNA, 5S rRNA, κάποια snRNA | Εσωτερικός προαγωγός (για tRNA, 5S rRNA), ανάντη προαγωγός (για κάποιο snRNA) |

Αυτός ο πίνακας δεν είναι εξαντλητικός, καθώς υπάρχουν διαφορετικοί τύποι προαγωγών και τα ρυθμιστικά στοιχεία τους σε κάθε ομάδα. Οι συγκεκριμένες αλληλουχίες και οι δομές των προαγωγών μπορούν να ποικίλουν, επηρεάζοντας την αποτελεσματικότητα και τη ρύθμιση της μεταγραφής.