Ένας επιστήμονας χωρίζει μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη από όλα τα άλλα συστατικά του κυττάρου ζύμης. Στη συνέχεια ψάχνει για μικρό μόριο που συνδέεται με την απομονωμένη πρωτεΐνη. Ποιος τύπος πειραματικού σχεδιασμού είναι;

Αυτός ο πειραματικός σχεδιασμός είναι ένας συνδυασμός μερικών διαφορετικών προσεγγίσεων, αλλά η βασική αρχή είναι Screening High-Throughput (HTS) . Εδώ είναι γιατί:

* Αναγνώριση στόχου: Ο επιστήμονας έχει ήδη εντοπίσει μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη ως πιθανό στόχο για την ανάπτυξη φαρμάκων.

* Προβολή βιβλιοθηκών: Ο επιστήμονας ψάχνει για ένα μικρό μόριο που συνδέεται με την πρωτεΐνη -στόχο. Αυτό συνήθως περιλαμβάνει την προβολή μιας βιβλιοθήκης χιλιάδων ή εκατομμυρίων μικρών μορίων.

* Υψηλή απόδοση: Για να προβάλλετε μια τόσο μεγάλη βιβλιοθήκη, ο επιστήμονας θα χρησιμοποιήσει αυτοματοποιημένες τεχνικές για να δοκιμάσει γρήγορα την ικανότητα του κάθε μόριο να δεσμεύεται με την πρωτεΐνη.

* Ανάπτυξη προσδιορισμού: Ο επιστήμονας πρέπει να αναπτύξει μια συγκεκριμένη δοκιμασία (πείραμα) για τη μέτρηση της συγγένειας δέσμευσης κάθε μορίου στην πρωτεΐνη. Αυτό θα μπορούσε να γίνει χρησιμοποιώντας μεθόδους όπως:

* ELISA (ενζυμική ανοσοπροσροφητική δοκιμασία): Αυτή η μέθοδος χρησιμοποιεί αντισώματα για την ανίχνευση της πρωτεΐνης και το δεσμευμένο μόριο.

* πόλωση φθορισμού: Αυτή η μέθοδος μετρά τη μεταβολή της πόλωσης του φθορίζοντος φωτός όταν το μόριο συνδέεται με την πρωτεΐνη.

* Συντονισμός επιφανειακού πλασμονίου (SPR): Αυτή η τεχνική μετρά την κινητική της δέσμευσης του μορίου στην πρωτεΐνη σε πραγματικό χρόνο.

Συνοπτικά: Ο επιστήμονας χρησιμοποιεί μια προσέγγιση διαλογής υψηλής απόδοσης για τον εντοπισμό μικρών μορίων που συνδέονται με μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη. Αυτή είναι μια κοινή στρατηγική στην ανακάλυψη φαρμάκων, όπου ο στόχος είναι να βρεθούν ενώσεις που μπορούν να ρυθμίσουν τη δραστικότητα μιας πρωτεΐνης που εμπλέκεται σε μια ασθένεια.