Τι αμινοξέος εξαπλώνεται στο νερό;
* Υδροφιλική Τα αμινοξέα προσελκύονται από το νερό και τείνουν να διαλύονται σε αυτό. Συχνά βρίσκονται στην επιφάνεια των πρωτεϊνών, αλληλεπιδρώντας με το υδατικό περιβάλλον.
* υδρόφοβη Τα αμινοξέα απωθούνται από το νερό και τείνουν να συσσωρεύονται μαζί μέσα στις πρωτεΐνες, μακριά από το υδατικό περιβάλλον.
αμινοξέα που είναι υδρόφιλα και απλωμένα στο νερό περιλαμβάνουν:
* σερίνη (ser, s): Έχει μια πολική υδροξυλομάδα (-ΟΗ).
* θρεονίνη (THR, T): Παρόμοια με τη σερίνη, με πολική υδροξυλομάδα (-ΟΗ).
* ασπαραγίνη (asn, n): Έχει μια πολική ομάδα αμιδίου (-CONH2).
* γλουταμίνη (Gln, Q): Παρόμοια με την ασπαραγίνη, με μια ομάδα πολικής αμιδίου (-CONH2).
* lysine (Lys, k): Έχει μια θετικά φορτισμένη ομάδα αμινο (-NH3+).
* Αργινίνη (arg, r): Έχει μια θετικά φορτισμένη ομάδα Guanidinium (-NH-C (=NH) -NH2).
* Ιστιδίνη (HIS, H): Έχει μια θετικά φορτισμένη ομάδα ιμιδαζόλης (-NH-CH =N-CH2-).
* ασπαρτικό οξύ (ASP, D): Έχει μια αρνητικά φορτισμένη καρβοξυλική ομάδα (-COO-).
* γλουταμικό οξύ (glu, e): Παρόμοια με το ασπαρτικό οξύ, με αρνητικά φορτισμένη καρβοξυλική ομάδα (-COO-).
* τυροσίνη (tyr, y): Έχει μια πολική υδροξυλομάδα (-ΟΗ) σε δακτύλιο βενζολίου.
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι η υδροφοβικότητα/υδροφιλικότητα ενός αμινοξέος είναι σχετική ιδιότητα και εξαρτάται από το συγκεκριμένο πλαίσιο. Για παράδειγμα, ένα υδρόφοβο αμινοξύ μπορεί να εκτεθεί σε νερό εάν είναι μέρος μιας μεγαλύτερης δομής πρωτεΐνης που του επιτρέπει να αλληλεπιδρά με το υδατικό περιβάλλον.