Ποια δομή είναι υπεύθυνη για τη σταθεροποίηση του DNA στη μορφή του μεμονωμένα;
* Χημικές τροποποιήσεις: Το μονόκλωνο DNA μπορεί να σταθεροποιηθεί με χημικές τροποποιήσεις όπως η μεθυλίωση ή η προσθήκη ειδικών πρωτεϊνών. Αυτές οι τροποποιήσεις μπορούν να μεταβάλλουν τη δομή του DNA και να καθιστούν λιγότερο πιθανό να αναδιπλώσουν τον εαυτό του και να σχηματίσουν διπλή έλικες περιοχές.
* Πρωτεΐνες δέσμευσης: Οι πρωτεΐνες που συνδέονται με το μονόκλωνο DNA (ssDNA) μπορούν να βοηθήσουν στη σταθεροποίησή του. Αυτές οι πρωτεΐνες μπορούν να εμποδίσουν το ssDNA να αναδιπλώσει τον εαυτό του και μπορεί επίσης να αποτρέψει την υποβάθμιση από τα ένζυμα.
* συνθήκες λύσης: Οι συνθήκες λύσης μπορούν επίσης να διαδραματίσουν κάποιο ρόλο στη σταθεροποίηση του ssDNA. Για παράδειγμα, οι υψηλές θερμοκρασίες ή οι χαμηλές συγκεντρώσεις άλατος μπορούν να προωθήσουν τη μετουσίωση του διπλού κλώνου DNA σε μεμονωμένα κλώνους.
Ωστόσο, είναι σημαντικό να θυμόμαστε ότι το μονόκλωνο DNA είναι εγγενώς λιγότερο σταθερό από το διπλό έλλειμμα DNA . Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι τα ζεύγη βάσης σε διπλό έλλευκο DNA συγκρατούνται μαζί με δεσμούς υδρογόνου, οι οποίοι είναι σχετικά ισχυρές αλληλεπιδράσεις. Το μονόκλωνο DNA δεν διαθέτει αυτές τις σταθεροποιητικές αλληλεπιδράσεις ζευγαρώματος βάσης, καθιστώντας το πιο ευαίσθητο στην υποβάθμιση και την αναδίπλωση.
Επομένως, είναι πιο ακριβές να πούμε ότι αυτοί οι παράγοντες μειώνουν την τάση του ssDNA να διπλώσει τον εαυτό του , αντί να "σταθεροποιήσει" με τον ίδιο τρόπο που σταθεροποιείται το DNA διπλού κλώνου.
