Από τι προκύπτουν οι πρωτεάσες;

Οι πρωτεάσες, επίσης γνωστές ως πεπτιδάσες, είναι ένζυμα που διασπούν πρωτεΐνες σε μικρότερα πεπτίδια ή αμινοξέα. Είναι κατασκευασμένα από αμινοξέα , όπως και όλες οι άλλες πρωτεΐνες.

Εδώ είναι μια κατανομή:

* Πρωτογενής δομή: Τα βασικά δομικά στοιχεία των πρωτεασών είναι αμινοξέα, που συνδέονται μαζί με μια συγκεκριμένη ακολουθία. Αυτή η ακολουθία καθορίζεται από το γονίδιο που κωδικοποιεί την πρωτεάση.

* Δευτερεύουσα δομή: Η αλυσίδα αμινοξέων αναδιπλώνεται σε άλφα-έλικες και βήτα-φύλλα, σχηματίζοντας εντοπισμένες δομές.

* Τριτοβάθμια δομή: Οι δευτερεύουσες δομές διπλώνουν περαιτέρω και αλληλεπιδρούν, σχηματίζοντας το τρισδιάστατο σχήμα της πρωτεάσης. Αυτό το σχήμα είναι ζωτικής σημασίας για τη λειτουργία του, καθώς δημιουργεί την ενεργό θέση όπου συνδέεται το υπόστρωμα πρωτεΐνης.

* Τεχνική δομή: Ορισμένες πρωτεάσες αποτελούνται από πολλαπλές πολυπεπτιδικές αλυσίδες (υπομονάδες) που συνδέονται μεταξύ τους.

Πέρα από τη βασική δομή αμινοξέων, οι πρωτεάσες μπορούν να κατηγοριοποιηθούν περαιτέρω με βάση:

* Πηγή: Μπορούν να παραχθούν από ζώα, φυτά, βακτήρια, μύκητες και ιούς.

* Ενεργός ιστότοπος: Η ενεργή θέση μιας πρωτεάσης είναι μια συγκεκριμένη περιοχή που αλληλεπιδρά με το υπόστρωμα πρωτεΐνης και σπάει τους πεπτιδικούς δεσμούς. Οι διαφορετικές πρωτεάσες έχουν διαφορετικές δομές ενεργού θέσης, οι οποίες καθορίζουν την εξειδίκευση του υποστρώματος τους.

* Μηχανισμός: Ο μηχανισμός με τον οποίο μια πρωτεάση διασπά τις πρωτεΐνες μπορεί να ποικίλει. Κάποιοι χρησιμοποιούν νερό για να διασπάσουν τον πεπτιδικό δεσμό (υδρόλυση), ενώ άλλοι χρησιμοποιούν άλλους μηχανισμούς.

Έτσι, ενώ τα βασικά δομικά στοιχεία των πρωτεασών είναι αμινοξέα, η συγκεκριμένη σύνθεση και δομή τους καθορίζει τη λειτουργία, την πηγή και τον μηχανισμό δράσης τους.