Τι σημαίνει ένα υδρόφοβο αμινοξύ;

Ένα υδρόφοβο αμινοξύ είναι ένα αμινοξύ που απωθεί το νερό . Αυτό σημαίνει ότι αποφεύγει την επαφή με μόρια νερού , προτιμώντας να συσχετίζεται με άλλα υδρόφοβα μόρια ή να ταφεί μέσα στο εσωτερικό ενός μορίου πρωτεϊνών.

Εδώ γιατί αυτό είναι σημαντικό:

* Αναδίπλωση πρωτεΐνης: Τα υδρόφοβα αμινοξέα παίζουν καθοριστικό ρόλο στην αναδίπλωση πρωτεϊνών. Τείνουν να συσσωρεύονται μαζί στο εσωτερικό της πρωτεΐνης, μακριά από το υδατικό περιβάλλον που περιβάλλει το κύτταρο. Αυτό δημιουργεί έναν σταθερό, υδρόφοβο πυρήνα που βοηθά την πρωτεΐνη να διατηρήσει το σχήμα του.

* Λειτουργία πρωτεΐνης: Οι υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις είναι επίσης σημαντικές για τις αλληλεπιδράσεις πρωτεΐνης-πρωτεΐνης και τη δέσμευση των προσδεμάτων (μόρια που δεσμεύονται με πρωτεΐνες). Για παράδειγμα, τα υδρόφοβα αμινοξέα στην ενεργό θέση ενός ενζύμου μπορεί να βοηθήσουν στη δέσμευση ενός υδρόφοβου υποστρώματος.

Παραδείγματα υδρόφοβων αμινοξέων:

* Alanine (ala, a)

* valine (val, v)

* leucine (leu, l)

* ισολευκίνη (Ile, i)

* Μεθειονίνη (Met, M)

* φαινυλαλανίνη (phe, f)

* Tryptophan (TRP, W)

* προλίνη (pro, p)

Τι κάνει αυτά τα αμινοξέα υδρόφοβα;

* μη πολικές πλευρικές αλυσίδες: Έχουν πλευρικές αλυσίδες που βασίζονται κυρίως σε υδρογονάνθρακες (που περιέχουν άτομα άνθρακα και υδρογόνου). Αυτές οι πλευρικές αλυσίδες δεν προσελκύονται από μόρια νερού, τα οποία είναι πολικά.

* υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις: Τα υδρόφοβα αμινοξέα τείνουν να αλληλεπιδρούν μεταξύ τους μέσω αδύναμων, μη ομοιοπολικών δυνάμεων που ονομάζονται υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις. Αυτές οι αλληλεπιδράσεις βοηθούν στην οδήγηση της αναδίπλωσης και της συναρμολόγησης των πρωτεϊνών.

Σε αντίθεση με τα υδρόφοβα αμινοξέα, τα υδρόφιλα αμινοξέα προσελκύονται από το νερό και συνήθως βρίσκονται στην επιφάνεια των πρωτεϊνών, όπου μπορούν να αλληλεπιδρούν με το περιβάλλον υδατικό περιβάλλον.