Ποια φόρτιση στα υδρόφοβα αμινοξέα έχουν στο PH6;

Τα υδρόφοβα αμινοξέα είναι γενικά μη πολικά και uncharged σε ρΗ 6.

Εδώ είναι γιατί:

* υδροφοβικότητα: Τα υδρόφοβα αμινοξέα έχουν πλευρικές αλυσίδες που δεν προσελκύονται από το νερό. Προτιμούν να βρίσκονται στο εσωτερικό των πρωτεϊνών, μακριά από το υδατικό περιβάλλον.

* μη πολικές πλευρικές αλυσίδες: Οι πλευρικές τους αλυσίδες δεν έχουν ομάδες που να κερδίζουν εύκολα ή να χάσουν πρωτόνια (ιόντα Η+) για να χρεωθούν.

* pH και ιονισμός: Το ρΗ ενός διαλύματος επηρεάζει την κατάσταση ιονισμού των αμινοξέων. Σε ρΗ 6, η καρβοξυλική ομάδα (COOH) αμινοξέων γενικά αποπρωτονώνεται (COO-) και η αμινομάδα (NH2) είναι γενικά πρωτονιωμένη (NH3+). Ωστόσο, αυτά τα φορτία βρίσκονται στη σπονδυλική στήλη του αμινοξέος, όχι στις πλευρικές αλυσίδες υδρόφοβων αμινοξέων.

Παραδείγματα υδρόφοβων αμινοξέων:

* Alanine (Ala, A)

* Valine (Val, V)

* Leucine (Leu, L)

* Ισολευκίνη (ile, i)

* Προλίνη (pro, p)

* Φαινυλαλανίνη (Phe, F)

* Tryptophan (TRP, W)

* Μεθειονίνη (Met, m)

Σημείωση: Ενώ αυτά τα αμινοξέα είναι συνήθως μη φορτισμένα σε ρΗ 6, ενδέχεται να υπάρχουν κάποιες μικρές παραλλαγές που βρίσκονται σε φόρτιση ανάλογα με το συγκεκριμένο πρωτεϊνικό περιβάλλον. Ωστόσο, το κύριο χαρακτηριστικό τους είναι η έλλειψη σημαντικής κατηγορίας.