Διαφορά μεταξύ αρωματικών και αλειφατικών αμινοξέων;
Αρωματικά αμινοξέα:
* Πλευρική αλυσίδα: Περιέχει ένα δακτύλιο βενζολίου ή άλλη αρωματική δομή.
* Ιδιότητες:
* υδρόφοβη: Οι αρωματικοί δακτύλιοι είναι σχετικά μη πολικοί και τείνουν να συσσωρεύονται μαζί στο εσωτερικό των πρωτεϊνών, μακριά από το νερό.
* Απορρόφηση UV: Απορροφούν έντονα την περιοχή UV, επιτρέποντας την ανίχνευση και την ποσοτικοποίηση.
* Planar: Οι αρωματικοί δακτύλιοι είναι επίπεδες και μπορούν να αλληλεπιδρούν με άλλα μόρια μέσω pi-stacking αλληλεπιδράσεις.
* Παραδείγματα:
* φαινυλαλανίνη (PHE)
* τυροσίνη (Tyr)
* Tryptophan (TRP)
Αλειφατικά αμινοξέα:
* Πλευρική αλυσίδα: Αποτελείται από ευθείες ή διακλαδισμένες αλυσίδες ατόμων άνθρακα και υδρογόνου . Δεν έχουν αρωματικά δαχτυλίδια.
* Ιδιότητες:
* υδρόφοβη ή υδρόφιλη: Οι αλειφατικές πλευρικές αλυσίδες μπορεί να είναι είτε μη πολικές (υδρόφοβες) είτε πολικές (υδρόφιες), ανάλογα με τις λειτουργικές ομάδες που υπάρχουν.
* Μεταβλητά μεγέθη και σχήματα: Οι αλειφατικές πλευρικές αλυσίδες μπορούν να κυμαίνονται από μικρά και συμπαγή (γλυκίνη) έως μεγάλα και ογκώδη (λευκίνη).
* Παραδείγματα:
* γλυκίνη (gly)
* Alanine (ala)
* valine (val)
* leucine (leu)
* ισολευκίνη (ILE)
Βασικές διαφορές κατά τη σύνοψη:
| Χαρακτηριστικό | Αρωματικά αμινοξέα | Αλειφατικά αμινοξέα |
| -------------------- | ------------------------------------------------------------------------------------------------
| Πλευρική αλυσίδα | Περιέχει δακτύλιο βενζολίου | Ευθείες ή διακλαδισμένες αλυσίδες άνθρακα και υδρογόνου |
| Υδροφοβικότητα | Κυρίως υδρόφοβη | Μπορεί να είναι υδρόφοβη ή υδρόφιλος |
| Απορρόφηση υπεριώδους | Ισχυρή | Αδύναμος |
| Σχήμα | Επίπεδη | Διάφορα |
Η παρουσία ή η απουσία ενός αρωματικού δακτυλίου επηρεάζει σημαντικά τις χημικές και φυσικές ιδιότητες των αμινοξέων, επηρεάζοντας τους ρόλους τους στη δομή και τη λειτουργία της πρωτεΐνης.