Διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA

Βασικές περιοχές που καλύπτονται

1. Τι είναι το snRNA
      – Ορισμός, Χαρακτηριστικά, Συνάρτηση
2. Τι είναι το snoRNA
      – Ορισμός, Χαρακτηριστικά, Συνάρτηση
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ snRNA και snoRNA
      – Περίληψη κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA
      – Σύγκριση βασικών διαφορών

Βασικοί όροι:Εναλλακτικό μάτισμα, Αποτύπωση γονιδιώματος, Τροποποίηση rRNA, Επεξεργασία mRNA, Μικρό πυρηνικό RNA (snRNA), Μικρό πυρηνικό RNA (snoRNA), U-RNA

Τι είναι το snRNA

Μικρό πυρηνικό RNA (snRNA) είναι ένας τύπος μικρού μη κωδικοποιητικού RNA, που αποτελείται από 80 έως 350 νουκλεοτίδια στα μόρια. Το snRNA ονομάζεται επίσης U-RNA και μπορούν να βρεθούν σε στίγματα και σώματα Cajal του πυρήνα. Το snRNA είναι ένα συστατικό των μικρών πυρηνικών ριβονουκλεοπρωτεϊνών (snRNPs), οι οποίες σχηματίζουν το μάτισμα που ελέγχει το μάτισμα των μορίων προ-mRNA κατά τις μετα-μεταγραφικές τροποποιήσεις. Το ευκαρυωτικό προ-mRNA αποτελείται τόσο από ιντρόνια όσο και από εξόνια. Τα εσώνια θα πρέπει να αφαιρεθούν από την αλληλουχία συνδέοντας εξόνια μαζί.

Εικόνα 1:Συνδυασμός RNA

Το εναλλακτικό μάτισμα στους ευκαρυώτες παράγει διαφορετικές αλληλουχίες mRNA, σχηματίζοντας διάφορους τύπους πρωτεϊνών. Ένα μάτισμα περιέχει περίπου 145 πρωτεΐνες. Αυτές οι πρωτεΐνες παίζουν ρόλο στη γονιδιακή έκφραση παρά στο μάτισμα. Οι πέντε τύποι snRNP που εμπλέκονται στο μάτισμα είναι οι U1, U2, U4, U5 και U6. Οι U2 και U6 ξεκινούν το μάτισμα. Η αφαίρεση ιντρονίων από μόρια προ-mRNA επιτυγχάνεται με βάση τρεις αλληλουχίες. Είναι μια θέση ματίσματος 5', ένα σημείο διακλάδωσης και μια θέση συνδέσεως 3'. Τυπικά, τα εσώνια ξεκινούν με GT και τελειώνουν με AT. Το εναλλακτικό μάτισμα επιτυγχάνεται με το συμπληρωματικό ζεύγος βάσεων μιας θέσης GT με τη θέση ΑΤ ενός άλλου ιντρονίου. Περίπου 15% μεταλλάξεις ενός σημείου στο pre-mRNA μπορεί να επηρεάσουν τη διαδικασία ματίσματος. Το μάτισμα RNA φαίνεται στο σχήμα 1.

Τι είναι το snoRNA

Μικρό πυρηνικό RNA (snoRNA) είναι ο άλλος τύπος μικρού μη κωδικοποιητικού RNA που εμπλέκεται στην τροποποίηση και επεξεργασία των προδρόμων rRNA και tRNA. Η κύρια λειτουργία του snoRNA είναι η ωρίμανση του rRNA κατά τον σχηματισμό του ριβοσώματος. Το snoRNA εμπλέκεται επίσης στην επεξεργασία του mRNA και στην αποτύπωση του γονιδιώματος. Το snoRNA μπορεί να έχει μήκος 80 έως 1000 νουκλεοτίδια στη ζύμη.

Εικόνα 2:  Δευτερεύουσα δομή του πλαισίου C/D snoRNA

Μπορούν να αναγνωριστούν δύο τύποι snoRNA με βάση τα διακριτά και εξελικτικά διατηρημένα στοιχεία αλληλουχίας που υπάρχουν σε κάθε snoRNA. Είναι το C/D box και το H/ACA box snoRNA. Το πλαίσιο C/D εμπλέκεται στη 2'-O-μεθυλίωση και το πλαίσιο H/ACA εμπλέκεται στην ψευδοουριδυλίωση. Μερικά από τα snoRNA είναι πανταχού παρόντα, άλλα είναι ειδικά για τον ιστό και άλλα είναι αποτυπωμένα. Η δευτερεύουσα δομή του πλαισίου C/D snoRNA φαίνεται στην εικόνα 2.

Ομοιότητες μεταξύ snRNA και snoRNA

• Το snRNA και το snoRNA είναι τύποι μικρού μη κωδικοποιητικού RNA στο κύτταρο.
• Τόσο το snRNA όσο και το snoRNA εμπλέκονται στην τροποποίηση του RNA μέσα στον πυρήνα.
• Ο φωσφορυλιωμένος προσαρμογέας για πυρηνική εξαγωγή (PHAX) εμπλέκεται στη μεταφορά κάθε snRNA και snoRNA στη θέση δράσης στον πυρήνα.

Διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA

Ορισμός

snRNA: Το snRNA είναι μια κατηγορία μικρού RNA που βρίσκεται στον πυρήνα των ευκαρυωτών και εμπλέκεται στην προ-mRNA επεξεργασία.

snoRNA: Το snoRNA είναι ένας τύπος μικρού RNA, που καθοδηγεί τις χημικές τροποποιήσεις του rRNA και άλλων RNA όπως το tRNA και το snRNA.

Σημαίνει για

snRNA: Το snRNA σημαίνει μικρό πυρηνικό RNA.

snoRNA: Το snoRNA σημαίνει μικρό πυρηνικό RNA.

Βρέθηκε στο

snRNA: Το snRNA βρίσκεται μόνο σε ευκαρυώτες.

snoRNA: Το snoRNA μπορεί να βρεθεί τόσο στους ευκαρυώτες όσο και στα αρχαία.

Μέγεθος

snRNA: Το μόριο snRNA έχει μήκος 80 έως 350 νουκλεοτίδια.

snoRNA: Το snoRNA έχει μήκος 80 έως 1000 νουκλεοτίδια στη ζύμη.

Συνάρτηση

snRNA: Το siRNA εμπλέκεται σε εναλλακτικό μάτισμα στους ευκαρυώτες.

snoRNA: Το snoRNA εμπλέκεται στην επεξεργασία του mRNA, στην τροποποίηση του rRNA και του tRNA και στην αποτύπωση γονιδιώματος.

Συμπέρασμα

Το snRNA και το snoRNA είναι δύο τύποι μικρού, μη κωδικοποιητικού RNA που εμπλέκονται στην επεξεργασία του πρόδρομου RNA. Το snRNA εμπλέκεται στο μάτισμα του ευκαρυωτικού mRNA κατά τις μετα-μεταγραφικές τροποποιήσεις. Το snoRNA εμπλέκεται στην ωρίμανση του rRNA και του tRNA. Επομένως, η κύρια διαφορά μεταξύ snRNA και snoRNA είναι η λειτουργία τους στην επεξεργασία του προδρόμου RNA.

Αναφορά:

1. "Τα SnRNA απαιτούνται για το μάτισμα." ΚΥΤΤΑΡΑ. Ν.π., ν.δ. Ιστός. Διαθέσιμο εδώ. 24 Ιουλίου 2017. 
2. «Ευκαρυωτικά snoRNAs:Ένα παράδειγμα για την ευελιξία έκφρασης γονιδίων». ScienceDirect. Ν.π., ν.δ. Ιστός. Διαθέσιμο εδώ. 24 Ιουλίου 2017. 
3. "MORE FUNCTIONAL RNA MOLECULES." ΓΕΝΕΣΙΟΛΟΓΙΑ. Ν.π., ν.δ. Ιστός. Διαθέσιμο εδώ. 24 Ιουλίου 2017. 

Εικόνα Ευγενική προσφορά:

1. "Διάγραμμα συναρμογής RNA en" Από LadyofHats (Δημόσιος Τομέας) μέσω Commons Wikimedia
2. "RF00071" – λήφθηκε από τη βάση δεδομένων Rfam (Δημόσιος Τομέας) μέσω Commons Wikimedia