Διαφορά μεταξύ αποικίας και υβριδισμού πλακών
Η κύρια διαφορά μεταξύ αποικίας και υβριδισμού πλάκας είναι ότι ο υβριδισμός αποικίας είναι η μέθοδος που χρησιμοποιείται στην επιλογή βακτηριακών αποικιών με τα επιθυμητά γονίδια, ενώ ο υβριδισμός πλάκας είναι η μέθοδος επιλογής φάγων με τα επιθυμητά γονίδια. Επιπλέον, ο υβριδισμός αποικιών μπορεί να χρησιμοποιηθεί στη διαλογή βιβλιοθηκών που βασίζονται σε πλασμίδιο ή κοσμίδιο, ενώ ο υβριδισμός πλάκας μπορεί να χρησιμοποιηθεί στη διαλογή βιβλιοθηκών φάγων.
Ο υβριδισμός αποικίας και πλάκας είναι δύο τεχνικές που χρησιμοποιούνται στη διαλογή βιβλιοθηκών γονιδιώματος ή cDNA. Ονομάζονται επίσης ανύψωση αποικιών και ανύψωση πλάκας αντίστοιχα.
Βασικές περιοχές που καλύπτονται
1. Τι είναι ο υβριδισμός αποικιών
– Ορισμός, τύπος βιβλιοθηκών, μέθοδοι διαλογής
2. Τι είναι ο υβριδισμός πλάκας
– Ορισμός, τύπος βιβλιοθηκών, μέθοδοι διαλογής
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ αποικίας και υβριδισμού πλακών
– Περίγραμμα κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ αποικίας και υβριδισμού πλακών
– Σύγκριση βασικών διαφορών
Βασικοί όροι
Colony, Colony Hybridization, Library Screening, Plaque, Plaque Hybridization
Τι είναι ο υβριδισμός αποικιών
Ο υβριδισμός αποικιών είναι μια μέθοδος διαλογής που χρησιμοποιείται στην επιλογή βακτηριακών αποικιών με μια επιθυμητή αλληλουχία DNA. Ονομάζεται επίσης υβριδισμός στυπώματος αποικίας, ανύψωση αποικιών ή αντίγραφο επιμετάλλωσης . Επιτρέπει τον έλεγχο των αποικιών που έχουν επιμεταλλωθεί με υψηλή πυκνότητα. Η αρχική διαδικασία υβριδισμού αποικιών αναπτύχθηκε για πρώτη φορά από τους Grunstein και Hogness. Πρώτον, οι βακτηριακές αποικίες μπορούν να μετασχηματιστούν σε μια μεμβράνη και οι βακτηριακές αποικίες λύονται, εκθέτοντας τα νουκλεϊκά οξέα. Στη συνέχεια, τα εκτεθειμένα νουκλεϊκά οξέα στερεώνονται στη μεμβράνη με τη μετουσίωση τους και υβριδοποιούνται με τους ραδιενεργούς ανιχνευτές.
Εικόνα 1:Μέθοδος υβριδισμού αποικιών
Μια αποικία είναι ένα σύμπλεγμα βακτηρίων που αναπτύχθηκε από ένα μόνο βακτηριακό κύτταρο μέσω της ασεξουαλικής αναπαραγωγής. Ως εκ τούτου, όλα τα βακτηριακά κύτταρα σε μια συγκεκριμένη αποικία διαθέτουν την ίδια γενετική σύνθεση καθώς και το μετασχηματισμένο γενετικό υλικό. Γενικά, τα βακτήρια μετασχηματίζονται με τη βοήθεια φορέων πλασμιδίου ή κοσμιδίου.
Τι είναι ο υβριδισμός πλακών
Ο υβριδισμός πλάκας είναι η μέθοδος διαλογής για ανασυνδυασμένους φάγους. Είναι μια τροποποίηση του υβριδισμού αποικιών από τους Benton και Devis το 1977. Η μέθοδος ονομάζεται επίσης ανύψωση πλάκας . Η διαδικασία υβριδισμού πλακών είναι παρόμοια με τη διαδικασία υβριδισμού αποικίας και οι πλάκες ανυψώνονται με επαφή τους σε μεμβράνη νιτροκυτταρίνης. Στη συνέχεια, τα νουκλεϊκά οξέα εκτίθενται και στερεώνονται στη μεμβράνη, υβριδοποιώντας με τους επιθυμητούς ανιχνευτές.
Εικόνα 2:Πλάκες σε πλάκα άγαρ
Η πλάκα είναι μια καθαρή ζώνη σε μια πλάκα άγαρ που παράγεται από έναν συγκεκριμένο βακτηριοφάγο με τη λύση των βακτηριακών κυττάρων σε αυτήν την περιοχή. Λόγω της μικρότερης ποσότητας DNA που μεταφέρεται στη μεμβράνη νιτροκυτταρίνης, ο υβριδισμός της πλάκας παράγει λιγότερα σήματα φόντου.
Ομοιότητες μεταξύ αποικίας και υβριδισμού πλακών
- Ο υβριδισμός αποικίας και πλάκας είναι δύο τεχνικές που χρησιμοποιούνται στη διαλογή γονιδιωματικών ή cDNA βιβλιοθηκών.
- Η κύρια αρχή και στις δύο τεχνικές είναι ο υβριδισμός νουκλεϊκού οξέος.
- Και οι δύο είναι μέθοδοι υβριδισμού φίλτρων, οι οποίες επιτρέπουν την αρχική διαλογή των βιβλιοθηκών με in Situ αντιγραφή σε μια μεμβράνη νιτροκυτταρίνης.
- Επιτρέπουν τον έλεγχο υψηλής πυκνότητας.
- Ένα μονόκλωνο μόριο DNA χρησιμοποιείται ως ανιχνευτής, ο οποίος μπορεί να υβριδοποιηθεί με τη συμπληρωματική αλληλουχία του για να αναγνωρίσει τις συγκεκριμένες αλληλουχίες.
- Και οι δύο τεχνικές υβριδισμού είναι γρήγορες και μπορούν να χειριστούν πολύ μεγάλο αριθμό κλώνων.
- Χρησιμοποιούνται για την αναγνώριση ελλιπών γονιδιακών αλληλουχιών, οι οποίες δεν μπορούν να εκφραστούν.
Διαφορά μεταξύ αποικίας και υβριδισμού πλάκας
Ορισμός
Ο υβριδισμός αποικιών αναφέρεται σε μια μέθοδο επιλογής βακτηριακών αποικιών με επιθυμητά γονίδια, ενώ ο υβριδισμός πλάκας αναφέρεται σε μια μέθοδο διαλογής που χρησιμοποιείται για την αναγνώριση ανασυνδυασμένων φάγων.
Αναπτύχθηκε από
Ο υβριδισμός αποικίας αναπτύχθηκε για πρώτη φορά από τους Grunstein και Hogness ενώ ο υβριδισμός πλακών αναπτύχθηκε για πρώτη φορά από τους Benton και Devis το 1977.
Τύποι βιβλιοθηκών
Ο υβριδισμός αποικιών περιλαμβάνει την ταυτοποίηση βιβλιοθηκών που βασίζονται σε πλασμίδιο ή κοσμίδιο, ενώ ο υβριδισμός πλάκας περιλαμβάνει την ταυτοποίηση βιβλιοθηκών φάγων.
Αριθμός ανελκυστήρων
Οι αποικίες μπορούν να ανυψωθούν για μία μόνο φορά, ενώ οι πλάκες μπορούν να ανυψωθούν πολλές φορές.
Σήματα παρασκηνίου
Περισσότερα σήματα φόντου εμφανίζονται στον υβριδισμό αποικιών ενώ τα σήματα φόντου είναι λιγότερα στον υβριδισμό πλάκας.
Συμπέρασμα
Ο υβριδισμός αποικιών είναι μια μέθοδος διαλογής βακτηριακών αποικιών στις βιβλιοθήκες που παράγονται με πλασμιδικούς ή κοσμιδικούς φορείς. Από την άλλη πλευρά, ο υβριδισμός πλάκας είναι μια μέθοδος διαλογής των βακτηριοφάγων στις βιβλιοθήκες φάγων. Η κύρια διαφορά μεταξύ του υβριδισμού αποικίας και πλάκας είναι ο τύπος των βιβλιοθηκών που εξετάζονται σε κάθε μέθοδο.
Αναφορά:
1. Kaksonen, Άννα. "Μοριακές Προσεγγίσεις για Μικροβιακή Κοινοτική Ανάλυση." Leaching – BioMineWiki, 20 Απριλίου 2006, Διαθέσιμο εδώ
2. Dale, J W και P J Greenaway. «Ταυτοποίηση ανασυνδυασμένων φάγων με υβριδισμό πλακών». Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.), U.S. National Library of Medicine, Διαθέσιμο εδώ
Εικόνα Ευγενική προσφορά:
1. «Υβριδισμός λεκέδων» Από τον Kaksonen – http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm (Δημόσιος Τομέας) μέσω Commons Wikimedia
2. "Μ. smegmatis plaque” By Wazzzup7up – Ίδιο έργο (Δημόσιος Τομέας) μέσω Commons Wikimedia
