Ποια είναι η διαφορά μεταξύ των μπροστινών και των αντίστροφων εκκινητών

Η κύρια διαφορά μεταξύ προς τα εμπρός και αντίστροφα εκκινητές είναι ότι οι εμπρόσθιοι εκκινητές ανόπτονται στον αντιπληροφοριακό κλώνο του δίκλωνου DNA, ο οποίος εκτείνεται από την κατεύθυνση 3' έως 5', ενώ οι αντίστροφοι εκκινητές ανόπτονται στον νοηματικό κλώνο του δίκλωνου DNA, το οποίο τρέχει από 5′ έως 3′ κατεύθυνση . Επιπλέον, οι εκκινητές 5' αναφέρονται σε εκκινητές προς τα εμπρός, ενώ οι εκκινητές 3' αναφέρονται σε αντίστροφους εκκινητές.

Οι εκκινητές εμπρός και ανάστροφοι είναι οι δύο τύποι εκκινητών που χρησιμοποιούνται στην PCR (αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης) για την ενίσχυση ενός συγκεκριμένου τμήματος ενός κλώνου DNA.

Βασικές περιοχές που καλύπτονται 

1. Τι είναι τα Forward Primers
     – Ορισμός, Χαρακτηριστικά, Σημασία
2. Τι είναι τα Reverse Primers
     – Ορισμός, Χαρακτηριστικά, Σημασία
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ των μπροστινών και των αντίστροφων εκκινητών
     – Περίληψη κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ των μπροστινών και των αντίστροφων εκκινητών
     – Σύγκριση βασικών διαφορών

Βασικοί όροι 

3' Primers, 5' Primers, Antisense Strand, Forward Primers, PCR, Reverse Primers, Sense Strand

Τι είναι τα Forward Primers 

Οι μπροστινοί εκκινητές είναι ένας από τους δύο τύπους εκκινητών που χρησιμοποιούνται σε μια εγκατάσταση PCR. Το κύριο σημαντικό χαρακτηριστικό των εμπρόσθιων εκκινητών είναι ότι ανόπτονται στον αντιπληροφοριακό ή (-) κλώνο του δίκλωνου DNA. Γενικά, ο αντιπληροφοριακός κλώνος χρησιμεύει ως κλώνος μήτρας για τη σύνθεση του mRNA. Επομένως, αυτός ο κλώνος είναι επίσης γνωστός ως σκέλος κωδικοποίησης.

Εικόνα 1:Ανόπτηση ασταριού

Ωστόσο, η κύρια λειτουργία των μπροστινών εκκινητών είναι να ενισχύουν τους αντινοηματικούς κλώνους κατά τη διάρκεια της PCR.

Τι είναι τα Reverse Primers  

Οι αντίστροφοι εκκινητές είναι ο δεύτερος τύπος εκκινητών που χρησιμοποιούνται στη ρύθμιση PCR. Ανοπτούνται στην αίσθηση ή στον (+) κλώνο του δίκλωνου DNA. Ο κλώνος αίσθησης είναι συμπληρωματικός του κλώνου προτύπου και επομένως, είναι γνωστός ως αντικωδικοποιητικός κλώνος.

Εικόνα 2:Λειτουργία Primer

Επιπλέον, η κύρια λειτουργία των αντίστροφων εκκινητών είναι η ενίσχυση των κλώνων αίσθησης κατά τη διάρκεια της PCR.

Similarities Between Forward and Reverse Primers 

• Οι εκκινητές εμπρός και ανάστροφος είναι δύο τύποι εκκινητές που είναι χρήσιμοι στην PCR.
• Και τα δύο είναι ολιγονουκλεοτίδια που χρησιμοποιούνται για την έναρξη PCR.
• Επίσης, το μήκος τους κυμαίνεται από 18 έως 25 ζεύγη βάσεων.
• Επιπλέον, εκτελούνται στο 5′ με κατεύθυνση 3′ από αριστερά προς τα δεξιά.
• Εξάλλου, αποτελούν συμπληρωματικό DNA, το οποίο ανόπτεται στο μονόκλωνο DNA κατά το στάδιο της ανόπτησης.
• Επιπλέον, η ανόπτησή τους γίνεται σε υψηλότερες θερμοκρασίες και οι θερμοκρασίες τήξης τους (Tm) πρέπει να είναι εντός 55°C και 65°C.
• Σημαντικό, η μέγιστη διαφορά μεταξύ της τήξης οι θερμοκρασίες και των δύο εκκινητών θα πρέπει να είναι  5°C.
• Επίσης, το περιεχόμενό τους GC θα πρέπει να είναι μεταξύ 40 και 60%, με το 3' ενός εκκινητή να τελειώνει σε C ή G για την προώθηση της δέσμευσης.
• Δεν πρέπει να περιέχουν περιοχές που σχηματίζουν δευτερεύουσες δομές .
• Επιπλέον, θα πρέπει να αποφεύγουν τα αυτοδιμερή /φουρκέτες και σχηματισμός αστάρι-διμερούς.

Διαφορά μεταξύ μπροστινών και αντίστροφων εκκινητών 

Ορισμός 

Οι μπροστινοί εκκινητές αναφέρονται στους εκκινητές PCR, οι οποίοι είναι συμπληρωματικοί προς τον αντιπληροφοριακό κλώνο του δίκλωνου DNA, ενώ οι αντίστροφοι εκκινητές αναφέρονται στους εκκινητές PCR, οι οποίοι είναι συμπληρωματικοί προς τον κλώνο με νόημα του δίκλωνου DNA. Έτσι, αυτή είναι η κύρια διαφορά μεταξύ των μπροστινών και των αντίστροφων εκκινητών.

Γνωστό και ως 

Οι εκκινητές 5' αναφέρονται σε εκκινητές προς τα εμπρός, ενώ οι εκκινητές 3' αναφέρονται σε αντίστροφους εκκινητές.

Συνάρτηση 

Επιπλέον, οι μπροστινοί εκκινητές είναι υπεύθυνοι για την ενίσχυση του αντιπληροφοριακού κλώνου, ενώ οι αντίστροφοι εκκινητές είναι υπεύθυνοι για την ενίσχυση του κλώνου αίσθησης.

Εμφάνιση 

Επίσης, μια άλλη διαφορά μεταξύ των μπροστινών και των αντίστροφων εκκινητών είναι ότι οι μπροστινοί εκκινητές εμφανίζονται στο 5′ άκρο του προϊόντος PCR, ενώ οι αντίστροφοι εκκινητές εμφανίζονται στο 3′ άκρο του προϊόντος PCR .

Συμπέρασμα 

Οι μπροστινοί εκκινητές είναι ένας από τους δύο εκκινητές που χρησιμοποιούνται στην PCR. Επιπλέον, ανόπτονται στον αντιπληροφοριακό κλώνο του DNA. Αντίθετα, οι αντίστροφοι εκκινητές είναι ο δεύτερος τύπος εκκινητών που χρησιμοποιούνται στην PCR. Αναπτύσσονται στον αισθητήριο κλώνο του DNA. Η κύρια λειτουργία τους είναι να ενισχύσουν ένα συγκεκριμένο κομμάτι DNA. Ωστόσο, η κύρια διαφορά μεταξύ των μπροστινών και των αντίστροφων εκκινητών είναι ο τύπος του κλώνου DNA στον οποίο ανόπτονται.