Ποια είναι η διαφορά μεταξύ των εκφρασμένων ετικετών ακολουθίας και του σχολιασμού ακολουθίας

Η κύρια διαφορά μεταξύ των εκφρασμένων ετικετών ακολουθίας και του σχολιασμού ακολουθίας είναι ότι οι εκφρασμένες ετικέτες αλληλουχίας (ESTs) είναι πλήρεις ή μερικές αλληλουχίες cDNA σημαντικές για την επιβεβαίωση των γονιδίων, ενώ ο σχολιασμός αλληλουχίας είναι τα δομικά και λειτουργικά συστατικά που προέρχονται από ένα γονίδιο.

Γενικά, οι εκφρασμένες ετικέτες ακολουθίας και ο σχολιασμός ακολουθιών είναι δύο σημαντικά στοιχεία για τον προσδιορισμό δομικών και λειτουργικών μερών του γονιδιώματος.

Βασικοί όροι

Ετικέτες εκφρασμένης ακολουθίας, σχολιασμός ακολουθίας

Τι είναι οι εκφρασμένες ετικέτες ακολουθίας

Ετικέτες εκφρασμένης ακολουθίας (ESTs) είναι σύντομες αλληλουχίες cDNA που είναι σημαντικές για τον προσδιορισμό νέων γονιδίων. Αυτές οι εκφρασμένες ετικέτες αλληλουχίας είναι επίσης σημαντικές για την αναγνώριση μεταγραφών γονιδίων. Η ζήτηση για εκφρασμένες ετικέτες αλληλουχίας είναι υψηλή σε ολόκληρο τον προσδιορισμό της αλληλουχίας του γονιδιώματος και του μεταγραφώματος. Ένα EST προκύπτει από την αλληλουχία μίας λήψης ενός κλωνοποιημένου cDNA. Γενικά, το cDNA για την παραγωγή EST προέρχεται από έναν μόνο κλώνο μιας βιβλιοθήκης cDNA. Επιπλέον, τα EST αντιπροσωπεύουν τμήματα εκφρασμένων γονιδίων. Είναι επίσης αλληλουχίες μήκους 500-800 bp.

Εικόνα 1:Βιβλιοθήκη CDNA

Επιπλέον, οι ετικέτες αλληλουχίας ενός συγκεκριμένου χρωμοσώματος εκφράζονται με τεχνικές φυσικής χαρτογράφησης όπως η υβριδική χαρτογράφηση ακτινοβολίας, η χαρτογράφηση Happy ή το FISH. Επιπλέον, τα EST ευθυγραμμίζονται με τις αλληλουχίες ενός νέου γονιδίου για να επιβεβαιώσουν ότι η νέα αλληλουχία γονιδίου αντιπροσωπεύει ένα γονίδιο. Γενικά, είναι ένα εργαλείο για την αναγνώριση γονιδίων από προβλεπόμενα μεταγραφήματα.

Τι είναι ο σχολιασμός ακολουθίας

Ο σχολιασμός ακολουθίας είναι η διαδικασία αναγνώρισης της θέσης των γονιδίων ή των περιοχών κωδικοποίησης των γονιδίων στο γονιδίωμα. Μόλις προσδιοριστεί η αλληλουχία, ο σχολιασμός του γονιδιώματος είναι σημαντικός για τον προσδιορισμό της δομής και της λειτουργίας του γονιδιώματος. Μετά τον σχολιασμό, το γονιδίωμα είναι γνωστό με γονιδιωματική θέση στα όρια εσωνίου-εξονίου, ρυθμιστικές αλληλουχίες, επαναλήψεις, ονόματα γονιδίων και πρωτεϊνικά προϊόντα. Επομένως, ο σχολιασμός ακολουθίας επιτρέπει την αναγνώριση λειτουργικών στοιχείων κατά μήκος του γονιδιώματος.

Εικόνα 2:Γονιδιακή δομή

Επιπλέον, τις τελευταίες τρεις δεκαετίες, ο σχολιασμός αλληλουχίας εξελίχθηκε σε δύο πτυχές:τον υπολογιστικό σχολιασμό μακρών γονιδίων που κωδικοποιούν πρωτεΐνες σε μεμονωμένα γονιδιώματα και τον πειραματικό σχολιασμό σύντομων ρυθμιστικών στοιχείων. Ωστόσο, ο σχολιασμός ακολουθίας είναι η διαδικασία εξαγωγής των δομικών και λειτουργικών πληροφοριών μιας ακολουθίας.

Ομοιότητες μεταξύ των εκφρασμένων ετικετών ακολουθίας και του σχολιασμού ακολουθίας

• Οι εκφρασμένες ετικέτες ακολουθιών και ο σχολιασμός ακολουθιών είναι δύο σημαντικοί παράγοντες για τον εντοπισμό δομικών και λειτουργικών τμημάτων ενός γονιδιώματος.
• Επιπλέον, και τα δύο βοηθούν στη σήμανση των στοιχείων του γονιδιώματος.

Διαφορά μεταξύ των εκφρασμένων ετικετών ακολουθίας και του σχολιασμού ακολουθίας

Ορισμός

Ετικέτες εκφρασμένης ακολουθίας (ESTs) αναφέρονται στις σύντομες (200–500 νουκλεοτίδια) αλληλουχίες cDNA που είναι σημαντικές για τον εντοπισμό ενός γονιδίου που εκφράζεται σε ένα κύτταρο σε μια συγκεκριμένη χρονική στιγμή κατά τον σχολιασμό της αλληλουχίας αναφέρεται στη διαδικασία επισήμανσης συγκεκριμένων χαρακτηριστικών σε μια αλληλουχία DNA, RNA ή πρωτεΐνης με περιγραφικές πληροφορίες σχετικά με τη δομή ή τη λειτουργία.

Σημασία

Συνήθως, οι εκφρασμένες ετικέτες αλληλουχίας είναι σύντομες αλληλουχίες cDNA που χρησιμοποιούνται για την αναγνώριση γονιδίων, ενώ ο σχολιασμός αλληλουχίας είναι η διαδικασία σήμανσης του DNA για συγκεκριμένες δομές και λειτουργίες.

Συνάρτηση

Οι εκφρασμένες ετικέτες αλληλουχίας είναι σημαντικές για τον εντοπισμό νέων γονιδίων στο γονιδίωμα, ενώ ο σχολιασμός αλληλουχίας είναι η διαδικασία σήμανσης του DNA στο γονιδίωμα για γονίδια.

Συμπέρασμα

Συνοπτικά, οι εκφρασμένες ετικέτες ακολουθίας και ο σχολιασμός ακολουθιών είναι δύο σημαντικοί παράγοντες για τον προσδιορισμό των δομικών και λειτουργικών μερών του γονιδιώματος. Οι εκφρασμένες ετικέτες αλληλουχιών είναι σύντομες αλληλουχίες cDNA που βοηθούν στην επιβεβαίωση νέων αλληλουχιών γονιδίων στο γονιδίωμα, ενώ ο σχολιασμός αλληλουχίας είναι η διαδικασία σήμανσης των δομικών και λειτουργικών τμημάτων του γονιδιώματος. Για παράδειγμα, τα EST είναι χρήσιμα για τον προσδιορισμό νέων γονιδίων στο γονιδίωμα. Ωστόσο, η κύρια διαφορά μεταξύ των εκφραζόμενων ετικετών αλληλουχίας και του σχολιασμού ακολουθιών είναι η λειτουργία τους στο γονιδίωμα.