Η μακροχρόνια δομή πρωτεΐνης μπορεί να βοηθήσει να αποκαλύψει πώς λειτουργεί ο «διακόπτης γονιδίων» (βίντεο)
Οι ερευνητές του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνιας, του Μπέρκλεϊ και του Ιατρικού Ινστιτούτου Howard Hughes (HHMI) εργάζονται σε αυτό το έργο για περισσότερα από 20 χρόνια. Τα ευρήματά τους, που δημοσιεύονται στο περιοδικό Nature, παρέχουν σημαντικές νέες γνώσεις για τον τρόπο με τον οποίο ρυθμίζονται τα γονίδια.
Η πρωτεΐνη, που ονομάζεται πεδίο δέσμευσης ενεργοποιητή (ABD) του παράγοντα μεταγραφής Gal4 ζυμομυκήτων, αποτελεί βασικό μέρος του μοριακού διακόπτη που ενεργοποιεί τα γονίδια ".
Το ABD δεσμεύεται με το DNA και προσλαμβάνει άλλες πρωτεΐνες που απαιτούνται για την έναρξη της μεταγραφής, τη διαδικασία αντιγραφής του DNA σε RNA. Όταν το ABD δεσμεύεται στο DNA, ο διακόπτης βρίσκεται στη θέση "ON". Όταν το ABD δεν δεσμεύεται στο DNA, ο διακόπτης βρίσκεται στη θέση "off".
Οι ερευνητές χρησιμοποίησαν κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ για να καθορίσουν τη δομή του ABD σε ατομικές λεπτομέρειες.
Αυτή η δομή αποκαλύπτει πώς ο Abd συνδέεται με το DNA και πώς αλληλεπιδρά με άλλες πρωτεΐνες. Η δομή παρέχει επίσης ενδείξεις για το πώς ρυθμίζεται το ABD.
Τα ευρήματα παρέχουν νέες γνώσεις για τον τρόπο με τον οποίο ρυθμίζονται τα γονίδια
Η δομή του ABD θα μπορούσε να βοηθήσει τους ερευνητές να σχεδιάσουν νέα φάρμακα που στοχεύουν την έκφραση γονιδίων ABD και ελέγχου. Αυτό θα μπορούσε να οδηγήσει σε νέες θεραπείες για μια ποικιλία ασθενειών, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου και του διαβήτη.