Η νέα τεχνική που καταγράφει βραχύβια μόρια RNA αποκαλύπτει πώς η μεταγραφή γονιδίων συντονίζεται σε κύτταρα
Τα μόρια RNA είναι απαραίτητα για την έκφραση γονιδίων, που ενεργούν ως αγγελιοφόροι που φέρουν γενετικές πληροφορίες από το DNA στο μηχανισμό παραγωγής πρωτεϊνών του κυττάρου. Ωστόσο, ορισμένα μόρια RNA είναι πολύ βραχύβια, υπάρχουν μόνο για λίγα δευτερόλεπτα ή λεπτά, καθιστώντας τα πρόκληση να μελετήσουν.
Η νέα τεχνική, που ονομάζεται SLAM-Seq (για ανάλυση RNA με βραχύβια με αλληλουχία ζεύγους MATE), ξεπερνά αυτή την πρόκληση χρησιμοποιώντας ένα συνδυασμό χημικής επισήμανσης και αλληλουχίας υψηλής απόδοσης για να συλλάβει και να εντοπίσει βραχύβια μόρια RNA.
Χρησιμοποιώντας SLAM-Seq, οι ερευνητές ήταν σε θέση να εντοπίσουν χιλιάδες βραχύβια μόρια RNA σε ανθρώπινα κύτταρα και να αναλύουν τα πρότυπα έκφρασής τους. Διαπίστωσαν ότι αυτά τα βραχύβια RNAs εμπλέκονται σε μια ποικιλία κυτταρικών διεργασιών, συμπεριλαμβανομένης της κυτταρικής ανάπτυξης, της διαφοροποίησης και της απόπτωσης.
Οι ερευνητές ανακάλυψαν επίσης ότι η έκφραση των βραχυπρόθεσμων RNAs συντονίζεται στενά με τη δραστικότητα της πολυμεράσης RNA II, του ενζύμου που μεταγράφει το DNA σε RNA. Αυτό υποδηλώνει ότι τα βραχύβια RNA διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της γονιδιακής μεταγραφής.
Η νέα τεχνική παρέχει ένα ισχυρό εργαλείο για τη μελέτη του ρόλου των βραχυπρόθεσμων RNA σε κυτταρικές διεργασίες και θα μπορούσε να οδηγήσει στην ανάπτυξη νέων θεραπειών για ασθένειες που προκαλούνται από διαταραχές στο μεταβολισμό του RNA.
Η μελέτη δημοσιεύεται στο περιοδικό Nature.
