Πώς οι πρωτεΐνες βρίσκουν τη θέση τους στο κελί
Η στόχευση πρωτεϊνών είναι μια πολύπλοκη διαδικασία που περιλαμβάνει έναν αριθμό διαφορετικών παραγόντων, συμπεριλαμβανομένης της αλληλουχίας αμινοξέων της πρωτεΐνης, της δομής της μεμβράνης του κυττάρου και της παρουσίας συγκεκριμένων σημάτων στόχευσης.
Η αλληλουχία αμινοξέων της πρωτεΐνης καθορίζει τη συνολική δομή και τη λειτουργία της πρωτεΐνης. Περιέχει επίσης πληροφορίες σχετικά με τον προορισμό στόχευσης της πρωτεΐνης. Αυτές οι πληροφορίες κωδικοποιούνται με τη μορφή συγκεκριμένων αλληλουχιών αμινοξέων που ονομάζονται σήματα στόχευσης.
Η δομή της μεμβράνης του κυττάρου παίζει επίσης ρόλο στην στόχευση πρωτεϊνών. Η κυτταρική μεμβράνη αποτελείται από μια φωσφολιπιδική διπλοστοιβάδα που είναι αδιαπέραστη στα περισσότερα μόρια. Προκειμένου να εισέλθουν στο κύτταρο, οι πρωτεΐνες πρέπει είτε να μεταφέρονται μέσω της μεμβράνης με συγκεκριμένη πρωτεΐνη μεταφοράς είτε πρέπει να εισαχθούν στην ίδια τη μεμβράνη.
Η παρουσία συγκεκριμένων σημάτων στόχευσης στην αλληλουχία αμινοξέων της πρωτεΐνης μπορεί να βοηθήσει να κατευθύνει την πρωτεΐνη στο σωστό κυτταρικό διαμέρισμα της. Αυτά τα σήματα μπορούν να αναγνωριστούν από συγκεκριμένους υποδοχείς στη μεμβράνη του κυττάρου ή στο κυτταρόπλασμα. Μόλις η πρωτεΐνη έχει αναγνωριστεί από έναν υποδοχέα, μπορεί να μεταφερθεί στον προορισμό της.
Η στόχευση πρωτεϊνών είναι μια κρίσιμη διαδικασία για τη σωστή λειτουργία των κυττάρων. Εξασφαλίζοντας ότι οι πρωτεΐνες βρίσκονται στο σωστό κυτταρικό διαμέρισμα, τα κύτταρα είναι σε θέση να εκτελούν τις βασικές τους λειτουργίες.
Ακολουθούν μερικά συγκεκριμένα παραδείγματα για το πώς οι πρωτεΐνες στοχεύουν στα σωστά κυτταρικά διαμερίσματα τους:
* μιτοχόνδρια: Οι πρωτεΐνες που στοχεύουν στα μιτοχόνδρια περιέχουν ένα συγκεκριμένο σήμα στόχευσης που ονομάζεται ακολουθία μιτοχονδριακής στόχευσης (MTS). Το MTS αναγνωρίζεται από έναν υποδοχέα στη μιτοχονδριακή μεμβράνη που ονομάζεται transcocase της εξωτερικής μεμβράνης (TOM). Το σύμπλεγμα Tom στη συνέχεια μεταφέρει την πρωτεΐνη στα μιτοχόνδρια.
* Ενδοπλασματικό δίκτυο: Οι πρωτεΐνες που στοχεύουν στο ενδοπλασματικό δίκτυο (ER) περιέχουν ένα συγκεκριμένο σήμα στόχευσης που ονομάζεται πεπτίδιο σήματος. Το πεπτίδιο σήματος αναγνωρίζεται από έναν υποδοχέα στη μεμβράνη ER που ονομάζεται σωματίδιο αναγνώρισης σήματος (SRP). Το σύμπλεγμα SRP μεταφέρει στη συνέχεια την πρωτεΐνη στο ER.
* λυσοσώματα: Οι πρωτεΐνες που στοχεύουν στα λυσοσώματα περιέχουν ένα συγκεκριμένο σήμα στόχευσης που ονομάζεται σήμα λυσοσωμικής στόχευσης (LTS). Το LTS αναγνωρίζεται από έναν υποδοχέα στη λυσοσωμική μεμβράνη που ονομάζεται πρωτεΐνη μεμβράνης που σχετίζεται με λυσοσώματα 1 (LAMP-1). Το σύμπλεγμα LAMP-1 στη συνέχεια μεταφέρει την πρωτεΐνη στο λυσοσώματα.
Αυτά είναι μόνο μερικά παραδείγματα για το πώς οι πρωτεΐνες στοχεύουν στα σωστά κυτταρικά διαμερίσματα τους. Η διαδικασία στόχευσης πρωτεϊνών είναι απαραίτητη για τη σωστή λειτουργία των κυττάρων και είναι μια πολύπλοκη περιοχή έρευνας.