Η νέα τεχνική χαρτογράφησης δείχνει πώς το RNA αλληλεπιδρά με χρωματίνη στο γονιδίωμα

Οι επιστήμονες έχουν αναπτύξει μια νέα τεχνική για τη χαρτογράφηση των αλληλεπιδράσεων μεταξύ του RNA και της χρωματίνης στο γονιδίωμα. Αυτή η τεχνική, που ονομάζεται ChIRP-nexus (απομόνωση χρωματίνης με καθαρισμό RNA που ακολουθείται από ανάλυση Nexus), παρέχει μια ολοκληρωμένη εικόνα για το πώς αλληλεπιδρούν τα μόρια RNA με το DNA και τις πρωτεΐνες εντός του πυρήνα.

Οι ερευνητές χρησιμοποίησαν ChIRP-Nexus για να μελετήσουν τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ RNA και χρωματίνης σε ανθρώπινα κύτταρα. Διαπίστωσαν ότι τα μόρια RNA αλληλεπιδρούν με ένα ευρύ φάσμα περιοχών χρωματίνης, συμπεριλαμβανομένων των γονιδιακών υποκινητών, των ενισχυτών και των σιγαστήρων. Αυτές οι αλληλεπιδράσεις διαδραματίζουν κρίσιμο ρόλο στη ρύθμιση των γονιδίων, καθώς μπορούν να ελέγξουν την προσβασιμότητα του DNA σε παράγοντες μεταγραφής και άλλες πρωτεΐνες.

"Η μέθοδος μας είναι μια εξαιρετικά ευαίσθητη και ευέλικτη πλατφόρμα για την παγκόσμια ανάλυση των αλληλεπιδράσεων RNA-χρωματίνης", δήλωσε ο ανώτερος συγγραφέας Dr. Chuan HE του Πανεπιστημίου του Σικάγο. "Μπορεί να εντοπίσει πρωτεΐνες δέσμευσης RNA με γονιδίωμα και αμερόληπτο τρόπο και τα αποτελέσματα μπορούν να εφαρμοστούν για την καλύτερη κατανόηση των μηχανισμών της γονιδιακής ρύθμισης και την ανάπτυξη νέων θεραπευτικών στρατηγικών για διάφορες ασθένειες".

Το Chirp-Nexus είναι ένα ισχυρό νέο εργαλείο που θα βοηθήσει τους επιστήμονες να κατανοήσουν καλύτερα πώς αλληλεπιδρούν τα μόρια RNA με τη χρωματίνη στο γονιδίωμα. Αυτές οι πληροφορίες θα είναι απαραίτητες για την κατανόηση της ρύθμισης των γονιδίων και την ανάπτυξη νέων θεραπευτικών στρατηγικών για ένα ευρύ φάσμα ασθενειών.