Η νέα τεχνική βοηθά τους ερευνητές να καθορίσουν τον τρόπο διαφοροποίησης των βλαστικών κυττάρων

Οι ερευνητές του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνιας του Σαν Φρανσίσκο (UCSF) έχουν αναπτύξει μια νέα τεχνική που τους επιτρέπει να καθορίζουν πώς τα βλαστοκύτταρα διαφοροποιούνται σε διαφορετικούς κυτταρικούς τύπους. Αυτή η τεχνική, που ονομάζεται αλληλουχία RNA ενός κυττάρου (scRNA-seq), επιτρέπει στους ερευνητές να μετρήσουν την γονιδιακή έκφραση μεμονωμένων κυττάρων, παρέχοντας ένα στιγμιότυπο των κυτταρικών διεργασιών που συμβαίνουν κατά τη διαφοροποίηση.

Για να χρησιμοποιήσουν το scRNA-seq, οι ερευνητές απομονώνουν πρώτα μεμονωμένα κύτταρα από ιστό ή όργανο. Στη συνέχεια χρησιμοποιούν ένα ειδικό όργανο για την αλληλουχία των μορίων RNA που υπάρχουν σε κάθε κύτταρο. Αυτές οι πληροφορίες στη συνέχεια αναλύονται χρησιμοποιώντας λογισμικό υπολογιστών για τον εντοπισμό των γονιδίων που εκφράζονται σε κάθε κύτταρο.

Συγκρίνοντας τα προφίλ γονιδιακής έκφρασης διαφορετικών κυττάρων, οι ερευνητές μπορούν να καθορίσουν τον τρόπο με τον οποίο τα βλαστοκύτταρα διαφοροποιούνται σε διαφορετικούς κυτταρικούς τύπους. Για παράδειγμα, μπορούν να αναγνωρίσουν τα γονίδια που είναι ενεργοποιημένα όταν τα βλαστοκύτταρα γίνονται νευρώνες, μυϊκά κύτταρα ή κύτταρα αίματος. Αυτές οι πληροφορίες μπορούν να βοηθήσουν τους ερευνητές να κατανοήσουν πώς ρυθμίζονται τα βλαστοκύτταρα και πώς μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη θεραπεία ασθενειών.

Το scRNA-seq είναι ένα ισχυρό νέο εργαλείο που παρέχει στους ερευνητές πληθώρα πληροφοριών σχετικά με τη διαφοροποίηση των βλαστικών κυττάρων. Αυτή η τεχνική έχει τη δυνατότητα να φέρει επανάσταση στο πεδίο της αναγεννητικής ιατρικής και να οδηγήσει σε νέες θεραπείες για ασθένειες όπως ο καρκίνος, οι καρδιακές παθήσεις και οι νευροεκφυλιστικές διαταραχές.

Εδώ είναι μερικά από τα πλεονεκτήματα του scRNA-seq:

* Παρέχει υψηλό επίπεδο ανάλυσης. Το scRNA-seq επιτρέπει στους ερευνητές να μετρήσουν την γονιδιακή έκφραση των μεμονωμένων κυττάρων, η οποία παρέχει πολύ υψηλότερο επίπεδο ανάλυσης από τις παραδοσιακές τεχνικές που μετρούν την γονιδιακή έκφραση των πληθυσμών των κυττάρων. Αυτό επιτρέπει στους ερευνητές να εντοπίζουν σπάνιους κυτταρικούς τύπους και να παρακολουθούν τις αλλαγές που εμφανίζονται στην έκφραση γονιδίων καθώς τα κύτταρα διαφοροποιούνται.

* Είναι αμερόληπτο. Το scRNA-seq δεν απαιτεί από τους ερευνητές να κάνουν υποθέσεις σχετικά με τα γονίδια που είναι σημαντικά. Αυτό επιτρέπει στους ερευνητές να ανακαλύψουν νέα γονίδια που εμπλέκονται στη διαφοροποίηση των βλαστικών κυττάρων.

* Είναι υψηλής απόδοσης. Το scRNA-seq μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την αλληλουχία των μορίων RNA από χιλιάδες κύτταρα ταυτόχρονα. Αυτό επιτρέπει στους ερευνητές να συλλέγουν γρήγορα και εύκολα μεγάλα ποσά δεδομένων.

Το scRNA-seq είναι ένας ταχέως αναπτυσσόμενος τομέας και οι νέες εφαρμογές για αυτήν την τεχνολογία ανακαλύπτονται συνεχώς. Αυτή η τεχνική έχει τη δυνατότητα να φέρει επανάσταση στην κατανόησή μας για τη διαφοροποίηση των βλαστικών κυττάρων και να οδηγήσει σε νέες θεραπείες για μια ποικιλία ασθενειών.