Ποιες είναι οι καλύτερες τριπλές νουκλεοτιδίων που αντιπροσωπεύουν ένα κωδικόνιο;
Ωστόσο, ορισμένα κωδικόνια θεωρούνται Προτιμώμενα κωδικόνια σε έναν συγκεκριμένο οργανισμό ή τύπο κυττάρου. Αυτά τα προτιμώμενα κωδικόνια χρησιμοποιούνται συχνότερα στη σύνθεση πρωτεϊνών και μπορούν να είναι πιο αποτελεσματικά στη μετάφραση. Παράγοντες που επηρεάζουν την προτίμηση κωδικονίου περιλαμβάνουν:
* είδη: Διαφορετικά είδη έχουν διαφορετικά προτιμώμενα κωδικόνια.
* γονίδιο: Μέσα σε ένα είδος, διαφορετικά γονίδια μπορούν να έχουν διαφορετικά προτιμώμενα κωδικόνια.
* Τύπος κυττάρου: Ακόμη και μέσα στον ίδιο οργανισμό, διαφορετικοί τύποι κυττάρων μπορούν να έχουν διαφορετικά προτιμώμενα κωδικόνια.
Γιατί υπάρχουν προτιμώμενα κωδικόνια;
* αφθονία tRNA: Τα κύτταρα έχουν ποικίλες ποσότητες διαφορετικών μορίων tRNA. Τα κωδικόνια που αντιστοιχούν σε πιο άφθονα tRNA προτιμώνται γενικά.
* απόδοση μετάφρασης: Ορισμένα κωδικόνια είναι πιο αποτελεσματικά στο να μεταφράζονται από άλλα. Αυτό μπορεί να οφείλεται στη δομή του tRNA ή στην αλληλεπίδραση με το ριβόσωμα.
Παραδείγματα προτιμώμενων κωδικώνων:
* Στους ανθρώπους, Αυγ είναι το πιο συνηθισμένο κωδικόνιο έναρξης και uag , uaa , και UGA είναι τα πιο κοινά κωδικόνια στάσης.
* Για την λευκίνη αμινοξέων, cua είναι ένα λιγότερο προτιμώμενο κωδικόνιο σε σύγκριση με uua ή cug .
Συμπέρασμα:
Ενώ όλα τα 64 κωδικόνια είναι έγκυρα, μερικά προτιμώνται σε σχέση με άλλους ανάλογα με παράγοντες όπως είδη, γονίδιο και τύπο κυττάρων. Αυτά τα προτιμώμενα κωδικόνια μεταφράζονται αποτελεσματικότερα και συμβάλλουν στη συνολική αποτελεσματικότητα της πρωτεϊνικής σύνθεσης.
