Τι είναι ένα εργαλείο που επιτρέπει τη μελέτη πολλών γονιδίων και τις αλληλεπιδράσεις τους ταυτόχρονα;
* microarrays: Αυτές είναι γυάλινες διαφάνειες με χιλιάδες ανιχνευτές DNA που συμπληρώνουν συγκεκριμένα γονίδια. Με την επισήμανση του DNA ή του RNA από ένα δείγμα με φθορίζουσα βαφή και την υβριδοποίηση του στη μικροσυστοιχία, οι ερευνητές μπορούν να προσδιορίσουν τα επίπεδα έκφρασης πολλών γονιδίων ταυτόχρονα.
* αλληλουχία επόμενης γενιάς (NGS): Αυτή η τεχνολογία επιτρέπει την αλληλουχία εκατομμυρίων ή δισεκατομμυρίων θραυσμάτων DNA ή RNA ταυτόχρονα. Παρέχει ένα ισχυρό εργαλείο για τη μελέτη της γονιδιακής έκφρασης, των μεταλλάξεων και των παραλλαγών με συνολικό τρόπο.
* αλληλουχία RNA (RNA-seq): Αυτή η τεχνική με βάση το NGS επιτρέπει την ποσοτικοποίηση των μεταγραφών RNA, παρέχοντας ένα στιγμιότυπο του μεταγραφικού στοιχείου, το οποίο περιλαμβάνει όλα τα μόρια RNA που υπάρχουν σε κύτταρο ή ιστό. Αυτό επιτρέπει στους ερευνητές να μελετούν την έκφραση γονιδίων, την εναλλακτική ματίσματος και άλλες τροποποιήσεις RNA.
* Ανοσοκαταβύθιση χρωματίνης (ChIP-seq): Αυτή η τεχνική επιτρέπει την ταυτοποίηση περιοχών DNA που δεσμεύονται από συγκεκριμένες πρωτεΐνες, όπως παράγοντες μεταγραφής. Με την αλληλουχία των θραυσμάτων ϋΝΑ που ανοσοκατακρημνίστηκαν με ένα αντίσωμα έναντι μιας συγκεκριμένης πρωτεΐνης, οι ερευνητές μπορούν να χαρτογραφήσουν τις θέσεις δέσμευσης αυτής της πρωτεΐνης σε όλο το γονιδίωμα.
* Μελέτες συσχέτισης σε όλο το γονιδίωμα (GWAS): Αυτές οι μελέτες αναλύουν τη γενετική σύνθεση μεγάλων πληθυσμών για τον εντοπισμό γονιδίων που σχετίζονται με συγκεκριμένα χαρακτηριστικά ή ασθένειες. Το GWAS μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τον εντοπισμό γονιδίων που εμπλέκονται σε σύνθετες βιολογικές διεργασίες, συμπεριλαμβανομένης της ρύθμισης των γονιδίων, του μεταβολισμού και της ανάπτυξης των ασθενειών.
* Συστήματα Βιολογίας προσεγγίσεις: Αυτές οι προσεγγίσεις χρησιμοποιούν υπολογιστικά μοντέλα και μαθηματικά εργαλεία για να μελετήσουν τις σύνθετες αλληλεπιδράσεις μεταξύ γονιδίων, πρωτεϊνών και άλλων κυτταρικών συστατικών. Οι προσεγγίσεις βιολογίας συστημάτων μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να κατανοήσουν πώς αυτές οι αλληλεπιδράσεις επηρεάζουν την κυτταρική λειτουργία και την ανάπτυξη της νόσου.
Αυτά είναι μόνο μερικά παραδείγματα των εργαλείων που είναι διαθέσιμα για τη μελέτη πολλών γονιδίων και των αλληλεπιδράσεών τους ταυτόχρονα. Το συγκεκριμένο εργαλείο που ταιριάζει καλύτερα σε ένα συγκεκριμένο ερευνητικό έργο θα εξαρτηθεί από το ερευνητικό ερώτημα και τον πειραματικό σχεδιασμό.
