Τα αμινοξέα μπορούν να διακριθούν μεταξύ τους;
1. Πλευρική αλυσίδα (ομάδα R): Αυτή είναι η πιο σημαντική διαφορά μεταξύ των αμινοξέων. Η πλευρική αλυσίδα είναι μια μοναδική χημική ομάδα που συνδέεται με το κεντρικό άτομο άνθρακα κάθε αμινοξέος. Ποικίλλει σε μέγεθος, σχήμα, φόρτιση και χημική αντιδραστικότητα. Αυτή η ποικιλομορφία στις πλευρικές αλυσίδες δίνει σε κάθε αμινοξύ τις ειδικές του ιδιότητες και καθορίζει τον ρόλο του στη δομή και τη λειτουργία της πρωτεΐνης.
2. Χειρίτρια (στερεοχημεία): Τα περισσότερα αμινοξέα είναι χειραλικά, που σημαίνει ότι υπάρχουν σε δύο μορφές καθρέφτη-εικόνας που ονομάζονται εναντιομερή (L-Isomer και D-Isomer). Οι ζωντανοί οργανισμοί χρησιμοποιούν κυρίως L-αμινοξέα.
3. Πολικότητα: Τα αμινοξέα μπορούν να ταξινομηθούν ως πολικά, μη πολικά ή χρεώνονται με βάση τις ιδιότητες των πλευρικών αλυσίδων τους.
* πολικά αμινοξέα έχουν πλευρικές αλυσίδες που είναι υδρόφιες (που αγαπούν το νερό) και μπορούν να σχηματίσουν δεσμούς υδρογόνου.
* μη πολικά αμινοξέα έχουν πλευρικές αλυσίδες που είναι υδρόφοβες (ανταπόκριση στο νερό).
* φορτισμένα αμινοξέα έχουν πλευρικές αλυσίδες που φέρουν θετικό ή αρνητικό φορτίο στο φυσιολογικό ρΗ.
4. Υδροφοβικότητα/υδροφιλικότητα: Αυτό σχετίζεται με την αλληλεπίδραση ενός αμινοξέος με νερό. Τα υδρόφοβα αμινοξέα τείνουν να συσσωρεύονται μαζί στο εσωτερικό των πρωτεϊνών, ενώ τα υδρόφιλα αμινοξέα είναι πιο πιθανό να βρεθούν στην επιφάνεια, αλληλεπιδρώντας με το υδατικό περιβάλλον.
5. Χημική αντιδραστικότητα: Διαφορετικά αμινοξέα έχουν διαφορετικές χημικές αντιδραστικές αντιδράσεις λόγω των μοναδικών λειτουργικών ομάδων που υπάρχουν στις πλευρικές τους αλυσίδες. Αυτή η αντιδραστικότητα παίζει ρόλο σε διάφορες ενζυματικές αντιδράσεις και αναδίπλωση πρωτεϊνών.
6. Ιδιότητες βάσης οξέος: Ορισμένα αμινοξέα έχουν πλευρικές αλυσίδες που μπορούν να δράσουν ως οξέα ή βάσεις, συμβάλλοντας στο συνολικό φορτίο και το pH των πρωτεϊνών.
7. Μέγεθος και σχήμα: Το μέγεθος και το σχήμα της πλευρικής αλυσίδας μπορούν επίσης να συμβάλλουν στη συνολική δομή και τη λειτουργία των πρωτεϊνών.
Συνοπτικά, ο μοναδικός συνδυασμός αυτών των χαρακτηριστικών επιτρέπει τη διαφοροποίηση ενός αμινοξέος από το άλλο. Αυτή η ποικιλομορφία στη δομή των αμινοξέων είναι ζωτικής σημασίας για το σχηματισμό του ευρέος φάσματος πρωτεϊνών με διαφορετικές λειτουργίες στους ζωντανούς οργανισμούς.
