Τι είναι το υδρόφιλο ένζυμο;

Ο όρος "υδρόφιλο ένζυμο" δεν είναι ένας τυπικός όρος που χρησιμοποιείται στη βιοχημεία ή την ενζυμολογία.

Εδώ είναι γιατί:

* Υδροφιλική σημαίνει "νερό που αγαπάει". Αναφέρεται σε μόρια ή μέρη μορίων που προσελκύονται από το νερό.

* Ένζυμα είναι βιολογικοί καταλύτες από πρωτεΐνες (ή μερικές φορές RNA). Έχουν συγκεκριμένα 3D σχήματα και περιοχές με διαφορετικές χημικές ιδιότητες.

Όλα τα ένζυμα είναι γενικά υδρόφιλα επειδή:

* Λειτουργούν σε υδατικά περιβάλλοντα: Τα ένζυμα λειτουργούν κυρίως στο υδατικό περιβάλλον των κυττάρων και των βιολογικών συστημάτων.

* αποτελούνται κυρίως από αμινοξέα: Τα αμινοξέα, τα δομικά στοιχεία πρωτεϊνών, έχουν πολικές ομάδες που αλληλεπιδρούν με το νερό.

* Οι ενεργές θέσεις τους είναι συχνά υδρόφιες: Η ενεργή θέση ενός ενζύμου, όπου το υπόστρωμα δεσμεύεται, συνήθως έχει σχεδιαστεί για να αλληλεπιδρά με το νερό και το υπόστρωμα.

Αντί του "υδρόφιλου ενζύμου", ένας πιο κατάλληλος τρόπος για να περιγράψουμε τα ένζυμα είναι η εξέταση του:

* Τοποθεσία: Πού βρίσκονται στο κελί ή στον οργανισμό; (π.χ., κυτταροπλασματικά ένζυμα, ένζυμα που συνδέονται με τη μεμβράνη)

* Λειτουργία: Τι είδους αντίδραση καταλύουν; (π.χ. υδρολάσες, οξειδορεδουκτασές, τρανσφεράες)

* Δομή: Ποιο είναι το τρισδιάστατο σχήμα τους και η διάταξη των αμινοξέων τους; (π.χ., άλφα-έλικες, βήτα-φύλλα)

Παράδειγμα:

"Το ένζυμο αμυλάση , που βρίσκεται στο σάλιο, είναι μια υδρολάση Αυτό διασπά το άμυλο σε σάκχαρα. Είναι μια σφαιρική πρωτεΐνη με μια υδρόφιλη ενεργή θέση Αυτό αλληλεπιδρά με τα μόρια του νερού που υπάρχουν στο σάλιο. "

Συνοπτικά, ενώ όλα τα ένζυμα έχουν υδρόφιλες ιδιότητες λόγω του περιβάλλοντος και της σύνθεσής τους, εστιάζοντας σε συγκεκριμένες πτυχές όπως η λειτουργία και η δομή τους είναι πιο ενημερωτική από το να τους καλούν απλά "υδρόφιλα ένζυμα".