Ποιες είναι οι πρωτεΐνες που αναγνωρίζονται;
1. Αμινοξύ αλληλουχία:
* Αυτή είναι η κύρια δομή και το πιο θεμελιώδες αναγνωριστικό.
* Η σειρά αμινοξέων καθορίζει το σχήμα, τη λειτουργία και τις αλληλεπιδράσεις της πρωτεΐνης.
2. Τρισδιάστατη δομή:
* Η Τριτογενή Δομή μιας πρωτεΐνης (διπλωμένο σχήμα) είναι επίσης σημαντική για την ταυτοποίηση.
* Αυτό το σχήμα καθορίζεται από την αλληλουχία αμινοξέων και διάφορες αλληλεπιδράσεις μεταξύ τους.
3. Μοριακό βάρος:
* Κάθε πρωτεΐνη έχει ένα μοναδικό μοριακό βάρος με βάση τη σύνθεση αμινοξέων.
* Αυτό μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τεχνικές διαχωρισμού και αναγνώρισης όπως η ηλεκτροφόρηση πηκτής.
4. Λειτουργία:
* Οι πρωτεΐνες συχνά ονομάζονται με βάση τη λειτουργία τους, όπως τα ένζυμα (π.χ., πολυμεράση ϋΝΑ), δομικές πρωτεΐνες (π.χ. κολλαγόνο) ή πρωτεΐνες σηματοδότησης (π.χ. ινσουλίνη).
5. Άλλα χαρακτηριστικά:
* μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις: Οι τροποποιήσεις μετά από σύνθεση πρωτεϊνών (π.χ., φωσφορυλίωση, γλυκοζυλίωση) μπορούν να επηρεάσουν τη λειτουργία και την ταυτοποίηση της πρωτεΐνης.
* εντοπισμός: Όταν μια πρωτεΐνη βρίσκεται μέσα σε ένα κύτταρο (π.χ. πυρήνας, κυτταρόπλασμα) μπορεί να είναι ενδεικτικό του ρόλου του.
Μέθοδοι για την ταυτοποίηση πρωτεϊνών:
* φασματομετρία μάζας: Προσδιορίζει τις πρωτεΐνες μετρώντας την αναλογία μάζας προς φόρτωση.
* Ανοσοστύπωση (στύπωμα Western): Χρησιμοποιεί αντισώματα για την ανίχνευση συγκεκριμένων πρωτεϊνών.
* χρωματογραφία: Διαχωρίζει πρωτεΐνες με βάση διαφορετικές ιδιότητες όπως το μέγεθος, το φορτίο ή η υδροφοβικότητα.
* ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΗ DNA: Αναλύοντας την αλληλουχία γονιδίων που κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη, μπορείτε να προσδιορίσετε τη δυνητική δομή και τη λειτουργία της.
Συνοπτικά, η αναγνώριση πρωτεΐνης συνδυάζει πληροφορίες από πολλαπλές πηγές, συμπεριλαμβανομένης της αλληλουχίας αμινοξέων, της δομής, της λειτουργίας και των διαφόρων τεχνικών που αναλύουν τα χαρακτηριστικά τους.
