Γιατί το mRNA έχει άνισες αναλογίες αζωτούχων βάσεων;
1. Ο γενετικός κώδικας:
* Ο γενετικός κώδικας, ο οποίος υπαγορεύει τη μετάφραση του mRNA σε πρωτεΐνες, βασίζεται σε κωδικόνια .
* Ένα κωδικόνιο είναι μια ακολουθία τριών αζώτων βάσεων (τριπλή) που καθορίζει ένα συγκεκριμένο αμινοξέο.
* Ο γενετικός κώδικας είναι εκφυλισμένος , που σημαίνει ότι πολλαπλά κωδικόνια μπορούν να κωδικοποιήσουν για το ίδιο αμινοξέο.
* Αυτός ο εκφυλισμός οδηγεί σε μια άνιση κατανομή των κωδικόνων και, κατά συνέπεια, μια άνιση κατανομή των βάσεων στο mRNA.
2. Προκατάληψη χρήσης κωδικονίου:
* Διαφορετικοί οργανισμοί, ακόμη και διαφορετικά γονίδια εντός του ίδιου οργανισμού, έχουν διαφορετικές προτιμήσεις για ορισμένα κωδικόνια, ακόμη και αν κωδικοποιούν για το ίδιο αμινοξύ.
* Αυτή η μεροληψία μπορεί να επηρεαστεί από διάφορους παράγοντες όπως:
* Διαθεσιμότητα tRNA: Η αφθονία συγκεκριμένων μορίων tRNA μπορεί να επηρεάσει τη συχνότητα ορισμένων κωδικώνων.
* Αποδοτικότητα μεταγραφής: Ορισμένα κωδικόνια ενδέχεται να μεταφραστούν πιο αποτελεσματικά από άλλα.
* Εξελικτικές πιέσεις: Ορισμένες προτιμήσεις κωδικονίου ενδέχεται να ευνοούνται σε ορισμένα περιβάλλοντα.
3. Μη κωδικοποιητικές περιοχές:
* Το mRNA περιέχει επίσης μη κωδικοποιημένες περιοχές, όπως η 5 'μη μεταφρασμένη περιοχή (5'UTR) και η 3' μη μεταφρασμένη περιοχή (3'UTR).
* Αυτές οι περιοχές μπορούν να έχουν ένα μεταβλητό μήκος και σύνθεση αλληλουχίας, συμβάλλοντας στη συνολική βάση της σύνθεσης του mRNA.
4. Συγκόλληση:
* Στα ευκαρυωτικά, το mRNA υφίσταται συρραφή, όπου απομακρύνονται τα μη κωδικοποιημένα ιντρόνια και τα εξόνια κωδικοποίησης συνδέονται μαζί.
* Αυτή η διαδικασία μπορεί να μεταβάλει τη σύνθεση βάσης του mRNA.
Συνοπτικά:
Οι άνισες αναλογίες των αζωτούχων βάσεων στο mRNA είναι συνέπεια του γενετικού κώδικα, η μεροληψία της χρήσης κωδικονίου, οι μη κωδικοποιημένες περιοχές και η συρραφή. Αυτοί οι παράγοντες συμβάλλουν στην πολυπλοκότητα και την ποικιλομορφία των αλληλουχιών mRNA, οι οποίες είναι απαραίτητες για τη σύνθεση πρωτεϊνών και την κυτταρική λειτουργία.
