Οι φυλογενετικές υποθέσεις είναι ισχυρότερες όταν;
1. Πολλές γραμμές αποδεικτικών στοιχείων:
* Μορφολογικά δεδομένα: Αυτό περιλαμβάνει ανατομικά χαρακτηριστικά, σκελετικές δομές και άλλα φυσικά χαρακτηριστικά.
* Μοριακά δεδομένα: Αυτό περιλαμβάνει αλληλουχίες DNA, αλληλουχίες πρωτεϊνών και άλλες γενετικές πληροφορίες.
* Αρχείο απολιθωμάτων: Αυτό παρέχει στοιχεία για τις προηγούμενες μορφές ζωής και τις σχέσεις τους.
* Βιογεωγραφικά δεδομένα: Αυτό περιλαμβάνει πληροφορίες σχετικά με τη διανομή των ειδών και τις σχέσεις τους με τη γεωλογική ιστορία.
2. Ισχυρή στατιστική υποστήριξη:
* Φυλογενετικές αναλύσεις: Αυτές είναι στατιστικές μέθοδοι που χρησιμοποιούν τα δεδομένα που αναφέρονται παραπάνω για να συμπεράνουν τις εξελικτικές σχέσεις. Θα πρέπει να χρησιμοποιούνται διαφορετικές μέθοδοι για να εξασφαλιστεί η συνέπεια στα αποτελέσματα.
* τιμές bootstrap: Αυτά μετρούν τη στατιστική υποστήριξη για συγκεκριμένους κλάδους σε ένα φυλογενετικό δέντρο. Οι υψηλές τιμές bootstrap (π.χ. πάνω από 95%) υποδεικνύουν ισχυρή υποστήριξη για τη σχέση.
* Bayesian οπίσθια πιθανότητες: Αυτά παρέχουν ένα μέτρο της πιθανότητας ότι μια συγκεκριμένη τοπολογία δέντρων είναι σωστή, δεδομένων των δεδομένων. Υψηλές πιθανότητες οπίσθιου (π.χ., πάνω από 0,95) υποδεικνύουν ισχυρή υποστήριξη.
3. Συνέπεια με άλλες βιολογικές παρατηρήσεις:
* Χαρακτηριστικά ιστορικού ζωής: Η φυλογενετική υπόθεση θα πρέπει να είναι συνεπής με τα γνωστά χαρακτηριστικά της ιστορίας της ζωής, όπως οι αναπαραγωγικές στρατηγικές, τα αναπτυξιακά πρότυπα και οι οικολογικοί ρόλοι.
* Βιογεωγραφικά πρότυπα: Η υπόθεση θα πρέπει να είναι συνεπής με τα γνωστά βιογεωγραφικά πρότυπα, όπως η κατανομή των ειδών και οι σχέσεις τους με τη γεωλογική ιστορία.
4. Parsimony:
* Η απλούστερη εξήγηση είναι συχνά η καλύτερη. Μια φυλογενετική υπόθεση που απαιτεί τις λιγότερες εξελικτικές αλλαγές για να εξηγηθεί τα παρατηρούμενα δεδομένα θεωρείται γενικά ισχυρότερη.
5. Ανεξαρτησία των δεδομένων:
* Οι διαφορετικές γραμμές αποδεικτικών στοιχείων που χρησιμοποιούνται για την υποστήριξη της υπόθεσης πρέπει να είναι ανεξάρτητες μεταξύ τους. Αυτό βοηθά στη μείωση του κινδύνου μεροληψίας και ενισχύει τη συνολική υπόθεση.
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι καμία φυλογενετική υπόθεση δεν είναι ποτέ «αποδεδειγμένη». Είναι πάντοτε υπόκεινται σε αναθεώρηση και βελτίωση, καθώς τα νέα δεδομένα διατίθενται. Ωστόσο, μια υπόθεση που υποστηρίζεται από πολλές γραμμές αποδεικτικών στοιχείων, ισχυρή στατιστική υποστήριξη και συνέπεια με άλλες βιολογικές παρατηρήσεις θεωρείται το ισχυρότερο και πιο αξιόπιστο.
