Μήπως ένα ένζυμο περιορισμού παράγει τα θραύσματα του ίδιου μεγέθους σε γονιδιωματικό DNA διαφορετικών ειδών;
* Παραλλαγή γονιδιώματος: Διαφορετικά είδη έχουν διαφορετικές αλληλουχίες DNA. Οι θέσεις αναγνώρισης για ένζυμα περιορισμού είναι ειδικές αλληλουχίες DNA. Εάν ένα είδος έχει διαφορετική αλληλουχία στην περιοχή όπου οι περικοπές των ενζύμων περιορισμού, δεν θα κόψουν εκεί.
* Μέγεθος και οργάνωση γονιδιώματος: Ακόμη και αν υπάρχει ο ίδιος χώρος αναγνώρισης σε δύο είδη, το συνολικό μέγεθος και η οργάνωση των γονιδιωμάτων τους μπορεί να είναι πολύ διαφορετικό. Αυτό σημαίνει ότι η απόσταση μεταξύ των τόπων κοπής θα ποικίλει, με αποτέλεσμα θραύσματα διαφορετικών μεγεθών.
* Εξελικτική απόκλιση: Με την πάροδο του χρόνου, τα είδη εξελίσσονται και οι αλληλουχίες τους DNA αλλάζουν. Αυτές οι αλλαγές μπορούν να εισαγάγουν ή να εξαλείψουν τους χώρους αναγνώρισης ενζύμων περιορισμού, οδηγώντας σε παραλλαγές σε μεγέθη θραυσμάτων.
Παράδειγμα:
Φανταστείτε ένα ένζυμο περιορισμού που αναγνωρίζει την ακολουθία "AAGCTT".
* Τα είδη Α μπορεί να έχουν πολλά αντίγραφα αυτής της ακολουθίας, οδηγώντας σε πολυάριθμα θραύσματα διαφορετικών μεγεθών.
* Το είδος Β μπορεί να έχει λιγότερα αντίγραφα ή η ακολουθία μπορεί να μεταλλαχθεί σε ορισμένες περιοχές, με αποτέλεσμα διαφορετικά μεγέθη θραυσμάτων σε σύγκριση με τα είδη Α.
Εξαιρέσεις:
Υπάρχουν κάποιες εξαιρέσεις σε αυτόν τον γενικό κανόνα:
* Εξαιρετικά διατηρημένες περιοχές: Ορισμένες περιοχές DNA είναι εξαιρετικά διατηρημένες σε όλα τα είδη. Εάν ένα ενζυμικό περιορισμό περικοπεί σε μια τέτοια διατηρημένη περιοχή, μπορεί να παράγει παρόμοια μεγέθη θραυσμάτων σε διαφορετικά είδη.
* Τεχνητά κατασκευάσματα: Σε εργαστηριακές ρυθμίσεις, οι ερευνητές μπορούν να χρησιμοποιήσουν ένζυμα περιορισμού για να μειώσουν συγκεκριμένες αλληλουχίες DNA που σκόπιμα έχουν σχεδιαστεί για να είναι τα ίδια μεταξύ των ειδών. Αυτό χρησιμοποιείται συχνά για κλωνοποίηση ή άλλους γενετικούς χειρισμούς.
Συνοπτικά: Η συντριπτική πλειονότητα του χρόνου, τα ένζυμα περιορισμού θα παράγουν διαφορετικά μεγέθη θραυσμάτων σε γονιδιωματικό DNA από διαφορετικά είδη λόγω διαφορών στις αλληλουχίες ϋΝΑ, στην οργάνωση του γονιδιώματος και στην εξελικτική απόκλιση.
