Πώς μπορούν να υπάρχουν τόσες πολλές διαφορετικές ουσίες στον κόσμο αν είναι μόνο μερικά στοιχεία που είναι κοινά;
Επιπλέον, πολλά στοιχεία μπορούν να υπάρχουν με διάφορες μορφές που ονομάζονται αλλοτροπές. Για παράδειγμα, ο άνθρακας μπορεί να υπάρχει ως γραφίτης, διαμάντι και φουλλερενίου. Αυτά τα αλλοτρόπια έχουν διαφορετικές φυσικές και χημικές ιδιότητες, οι οποίες μπορούν να οδηγήσουν σε ακόμη μεγαλύτερη ποικιλία στις ουσίες που μπορούν να σχηματιστούν.
Τέλος, οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ μορίων και ατόμων μπορούν επίσης να οδηγήσουν στον σχηματισμό νέων ουσιών. Για παράδειγμα, όταν τα μόρια νερού αλληλεπιδρούν με το διοξείδιο του άνθρακα, μπορούν να σχηματίσουν ανθρακικό οξύ. Αυτή η αντίδραση είναι υπεύθυνη για τις φυσαλίδες σε ανθρακούχα ποτά.