Γιατί η αργινίνη είναι το πιο βασικό αμινοξέο;

Ενώ η αργινίνη είναι ένα εξαιρετικά βασικό αμινοξύ, δεν είναι τεχνικά το "πιο βασικό" αμινοξύ. λυσίνη θεωρείται γενικά το πιο βασικό αμινοξύ λόγω της τιμής ΡΚΑ.

Εδώ είναι γιατί:

* τιμές pka: Η τιμή PKA είναι ένα μέτρο για το πόσο εύκολα ένα μόριο δωρίζει ένα πρωτόνιο (Η+). Ένα χαμηλότερο ΡΚΑ υποδεικνύει ένα ισχυρότερο οξύ, ενώ ένα υψηλότερο ΡΚΑ δείχνει μια ισχυρότερη βάση.

* pka της λυσίνης: Η αμινομάδα της λυσίνης της πλευρικής αλυσίδας έχει PKA περίπου 10,5, καθιστώντας την σχετικά ισχυρή βάση.

* PKA της Αργινίνης: Η ομάδα Guanidino της αργινίνης έχει PKA περίπου 12,5. Ενώ αυτό είναι υψηλότερο από το PKA της Lysine, είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι το PKA της ομάδας Guanidino επηρεάζεται από τις δομές συντονισμού της, καθιστώντας την πιο αδύναμη βάση από την απλή αμινομάδα της λυσίνης.

Ως εκ τούτου, η υψηλότερη PKA της λυσίνης και η απλούστερη αμινομάδα της το καθιστούν ισχυρότερη βάση από την αργινίνη.

Ωστόσο, τόσο η αργινίνη όσο και η λυσίνη θεωρούνται βασικά αμινοξέα λόγω της παρουσίας των θετικά φορτισμένων πλευρικών αλυσίδων σε φυσιολογικό ρΗ.