Τα άτομα υδρογόνου σε μόρια νερού τα ίδια με όλα τα άλλα άτομα;
* ισότοπα: Το υδρογόνο έχει τρία ισότοπα:πρωτόνιο (¹H), δευτερίιο (²H) και τρίνιο (³H). Ενώ το πρωτόνιο είναι το πιο συνηθισμένο, και τα τρία ισότοπα μπορούν να βρεθούν στο νερό. Το Deuterium έχει ένα επιπλέον νετρόνιο, καθιστώντας το βαρύτερο από το πρωτόνιο, και το Tritium έχει δύο επιπλέον νετρόνια. Αυτές οι διαφορές στη μάζα μπορούν να επηρεάσουν τις φυσικές ιδιότητες του μορίου νερού.
* Χημικό περιβάλλον: Ακόμη και τα άτομα πρωτόνου σε μόρια νερού μπορεί να είναι ελαφρώς διαφορετικά από άλλα άτομα πρωτόνου. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι το χημικό περιβάλλον που περιβάλλει ένα άτομο μπορεί να επηρεάσει τις ιδιότητές του. Για παράδειγμα, τα άτομα υδρογόνου σε μόρια νερού συνδέονται με το οξυγόνο, τα οποία μπορούν να μεταβάλλουν ελαφρώς την κατανομή και την αντιδραστικότητα τους.
Ως εκ τούτου, ενώ όλα τα άτομα υδρογόνου μοιράζονται την ίδια βασική δομή (ένα πρωτόνιο και ένα ηλεκτρόνιο), μπορούν να ποικίλουν στην ισοτοπική τους σύνθεση και στο συγκεκριμένο χημικό περιβάλλον τους, καθιστώντας τους εντελώς ταυτόσημες.