Ποια είναι η διαφορά μεταξύ dNTP και ddNTP

Η κύρια διαφορά μεταξύ dNTP και ddNTP είναι ότι τα dNTP αποτελούνται από σάκχαρο δεοξυριβόζης ενώ τα ddNTP αποτελούνται από σάκχαρο διδεοξυριβόζης.

Συνοπτικά, τα dNTP και τα ddNTP είναι νουκλεοτίδια, τα βασικά δομικά στοιχεία των μορίων DNA. Τα νουκλεοτίδια DNA αποτελούνται από σάκχαρο δεοξυριβόζης, αζωτούχα βάση και φωσφορική ομάδα. Επιπλέον, τα νουκλεοτίδια σχηματίζουν φωσφοδιεστερικούς δεσμούς για να σχηματίσουν DNA. Και, το DNA είναι ένα δίκλωνο μόριο του οποίου η κύρια λειτουργία είναι να μεταφέρει τις γενετικές πληροφορίες ενός οργανισμού.

Βασικοί όροι

ddNTPs, DNA, dNTPs

Τι είναι τα dNTP

το dNTP ή τα δεοξυριβονουκλεοτίδια είναι ένα νουκλεοτίδιο που περιέχει δεοξυριβόζη ως μόριο σακχάρου. Αυτά τα νουκλεοτίδια ονομάζονται νουκλεοτίδια DNA. Επίσης, υπάρχουν τέσσερα dNTP. είναι dATP, dGTP, dGTP και dTTP. Εξετάζοντας τις λειτουργίες τους, τα dNTP είναι τα πρόδρομα μόρια του DNA. Η κύρια λειτουργία των νουκλεοτιδίων DNA είναι να μεταφέρουν γενετικές πληροφορίες μέσω του DNA από τη μια γενιά στην άλλη.

Εικόνα 1:DNA

Επιπλέον, τα τρία συστατικά του dNTP είναι το σάκχαρο δεοξυριβόζης, η αζωτούχα βάση και η φωσφορική ομάδα. Το σάκχαρο δεοξυριβόζης περιέχει μια ομάδα 3' ΟΗ. Οι αζωτούχες βάσεις περιλαμβάνουν είτε τις πουρινικές είτε τις βάσεις πυριμιδίνης. Επιπλέον, οι αζωτούχες βάσεις σχηματίζουν δεσμούς υδρογόνου για να σχηματίσουν ζεύγη βάσεων κατά τη σύνθεση του DNA. Κατά τη σύνθεση του DNA, η ομάδα 3' ΟΗ σχηματίζει έναν φωσφοδιεστερικό δεσμό με τη φωσφορική ομάδα στον άνθρακα 4' του δεύτερου νουκλεοτιδίου δεοξυριβόζης.

Τι είναι τα ddNTP

τα ddNTP είναι ένας τύπος νουκλεοτιδίου που είναι σημαντικός στην αντίδραση τερματισμού αλυσίδας της αλληλουχίας Sanger. Το κύριο χαρακτηριστικό των ddNTPs είναι ότι περιέχουν μια ομάδα σακχάρου διδεοξυριβόζης. Επίσης δεν περιέχει ομάδα 3' ΟΗ. Εκτός από αυτό,  τα ddNTP περιέχουν μια αζωτούχα βάση στο 1' άτομο άνθρακα και μια φωσφορική ομάδα στο 4' άτομο άνθρακα, ίδια με τα dNTP.

Εικόνα 2:ddNTPs

Επιπλέον, η αλληλουχία sanger είναι μια μέθοδος που ενισχύει το DNA-στόχο για τη λεπτομερή μελέτη των αλληλουχιών. Αυτή η μέθοδος χρησιμοποιεί ένα μείγμα dNTP και ddNTP στην αλληλουχία. Καθώς η αλυσίδα του DNA αρχίζει να επιμηκύνεται, ένα ddNTP ενσωματώνεται τυχαία στην αλυσίδα. Επειδή όμως ένα ddNTP δεν έχει ομάδα 3'ΟΗ, δεν μπορεί να σχηματιστεί φωσφοδιεστερικός δεσμός για την προσθήκη του επόμενου νουκλεοτιδίου. Ως εκ τούτου, η αλυσίδα σταματά την ανάπτυξή της.

Για αυτόν τον λόγο, τα ddNTP είναι επίσης γνωστά ως «νουκλεοτίδια τερματισμού αλυσίδας». Τα τέσσερα ddNTP είναι τα ddATP, ddGTP, ddCTP και ddTTP. Αυτά τα νουκλεοτίδια επισημαίνονται με φθορισμό στη μέθοδο προσδιορισμού αλληλουχίας για εύκολη ανίχνευση.

Ομοιότητες μεταξύ dNTPs και ddNTPs

• Τα dNTP και τα ddNTP είναι δύο τύποι νουκλεοτιδίων με διαφορετικές δομές και λειτουργίες.
• Η ζάχαρη, η αζωτούχα βάση και η φωσφορική ομάδα είναι τα τρία συστατικά ενός νουκλεοτιδίου. Επιπλέον, τα νουκλεοτίδια σχηματίζουν φωσφοδιεστερικούς δεσμούς για να σχηματίσουν DNA.

Διαφορά μεταξύ dNTPs και ddNTPs

Ορισμός

τα dNTP αναφέρονται σε τριφωσφορικά δεοξυριβονουκλεοτίδια και κάθε dNTP αποτελείται από μια φωσφορική ομάδα, σάκχαρο δεοξυριβόζης και μια αζωτούχα βάση, ενώ τα ddNTP αναφέρονται σε τριφωσφορικά διδεοξυνουκλεοτίδια, τα οποία χρησιμοποιούνται στο Sanger διδεοξυ μέθοδος για την παραγωγή διαφορετικών μηκών κλώνων DNA για DNA.

Συνάρτηση

Εξάλλου, τα dNTP είναι δομικά στοιχεία του DNA ενώ τα ddNTP είναι τα νουκλεοτίδια που χρησιμοποιούνται στη μέθοδο προσδιορισμού αλληλουχίας Sanger.

Δομή

Επίσης, τα dNTPs περιέχουν μια ομάδα 3' ΟΗ στο σάκχαρο δεοξυριβόζης, ενώ τα ddNTP δεν περιέχουν μια ομάδα 3' ΟΗ στο διδεοξυριβοζάχαρο.

Φωσφοδιεστερικός δεσμός

Τα dNTP μπορούν να σχηματίσουν φωσφοδιεστερικούς δεσμούς ενώ τα ddNTP δεν μπορούν να σχηματίσουν φωσφοδιεστερικούς δεσμούς.

Σύνθεση DNA

Επιπλέον, τα dNTP συνεχίζουν τη σύνθεση DNA ενώ τα ddNTP τερματίζουν τη σύνθεση DNA.

Χρήση

Επιπλέον, τα dNTP είναι σημαντικά στη σύνθεση του DNA ενώ τα ddNTP είναι σημαντικά στην αντίδραση τερματισμού αλυσίδας της μεθόδου προσδιορισμού αλληλουχίας Sanger.

Συμπέρασμα

Συνοπτικά, τα dNTP είναι δεοξυριβονουκλεοτίδια που περιέχουν μια ομάδα ΟΗ 3'. Τα τρία συστατικά των dNTPs είναι το σάκχαρο δεοξυριβόζης, η αζωτούχα βάση και η φωσφορική ομάδα. Η κύρια λειτουργία των dNTP είναι να συμμετέχουν στη σύνθεση του DNA. Από την άλλη πλευρά, τα ddNTP περιέχουν διδεοξυριβονουκλεοτίδιο που δεν περιέχει ομάδα 3' ΟΗ στο σάκχαρο. Επιπλέον, η κύρια λειτουργία των ddNTP είναι να συμμετέχουν στη μέθοδο τερματισμού αλυσίδας της αλληλουχίας Sanger. Έτσι, η κύρια διαφορά μεταξύ dNTP και ddNTP είναι η δομή και η λειτουργία τους.