Πώς τα ριβοσώματα στα κύτταρα μας επιτρέπουν την αναδίπλωση πρωτεΐνης
1.
Τα ριβοσώματα χρησιμεύουν ως τόπος για συν-μεταφραστική αναδίπλωση, πράγμα που σημαίνει ότι η αναδίπλωση μιας πρωτεΐνης αρχίζει καθώς συντίθεται στο ριβόσωμα. Το ριβόσωμα παρέχει ένα δομημένο περιβάλλον όπου η αλυσίδα πολυπεπτιδίου που αρχίζει να υιοθετεί την εγγενή διαμόρφωσή της.
2.
Το ριβόσωμα συνδέεται με διάφορες πρωτεΐνες συνοδού που βοηθούν στην αναδίπλωση των νεογνών πρωτεϊνών. Αυτές οι συνοδές δεσμεύονται στις εκτεθειμένες υδρόφοβες περιοχές της πολυπεπτιδικής αλυσίδας, εμποδίζοντας τη συσσωμάτωση και προωθώντας την κατάλληλη αναδίπλωση. Οι chaperones διευκολύνουν επίσης το σχηματισμό δισουλφιδικών δεσμών, οι οποίοι είναι σημαντικοί για τη σταθεροποίηση της δομής της πρωτεΐνης.
3. Έξοδος σήραγγας:
Το ριβόσωμα έχει μια στενή σήραγγα μέσω της οποίας αναδύεται η εκκολαπτόμενη πολυπεπτιδική αλυσίδα. Αυτή η σήραγγα λειτουργεί ως σημείο ελέγχου ποιότητας. Οι πρωτεΐνες που αποτυγχάνουν να διπλώνουν σωστά μπορούν να διατηρηθούν μέσα στη σήραγγα και να στοχεύουν για υποβάθμιση.
4. Στόχοι και πτυσσόμενα διαμερίσματα πρωτεϊνών:
Τα ριβοσώματα μπορούν να υπάρχουν σε συγκεκριμένα κυτταρικά διαμερίσματα, όπως το ενδοπλασματικό δίκτυο (ER). Το ER παρέχει ένα περιβάλλον που είναι βελτιστοποιημένο για αναδίπλωση πρωτεϊνών, που περιέχει αναδίπλωματα ένζυμα, συνοδούς και άλλους παράγοντες που βοηθούν στην σωστή αναδίπλωση πρωτεϊνών.
5. Καταλύτες αναδίπλωσης πρωτεϊνών:
Ορισμένα ριβοσώματα περιέχουν ένζυμα που ονομάζονται πεπτιδυλ-προρολυλο ισομερύσεις (PPIs). Τα ΡΡΙ καταλύουν την αλληλοσύνδεση ισομερών προλίνης, τα οποία μπορούν να επηρεάσουν σημαντικά τις οδούς αναδίπλωσης πρωτεϊνών. Με την προώθηση του σωστού ισομερισμού των υπολειμμάτων προλίνης, οι ΡΡΙ διευκολύνουν την αποτελεσματική αναδίπλωση των πρωτεϊνών.
6. Αλληλεπίδραση με ριβοσωμικό RNA:
Το ριβοσωμικό RNA (rRNA), ένα συστατικό του ριβοσώματος, μπορεί επίσης να διαδραματίσει κάποιο ρόλο στην αναδίπλωση πρωτεϊνών. Τα μόρια rRNA περιέχουν συγκεκριμένες αλληλουχίες που μπορούν να αλληλεπιδρούν με συγκεκριμένες περιοχές της εκκολαπτόμενης πολυπεπτιδικής αλυσίδας, καθοδηγώντας τη διαδικασία αναδίπλωσης και σταθεροποιώντας ορισμένες διαμορφώσεις.
7. Μετατόπιση και αναδίπλωση:
Καθώς το ριβόσωμα συνθέτει την πρωτεΐνη και κινείται κατά μήκος του αγγελιοφόρου RNA (mRNA), διαμεσολαβεί επίσης τη μετατόπιση της αναπτυσσόμενης πολυπεπτιδικής αλυσίδας μέσω της σήραγγας. Αυτή η μετατόπιση μπορεί να προκαλέσει αλλαγές διαμόρφωσης στην πρωτεΐνη, προωθώντας περαιτέρω την αναδίπλωση και αποτρέποντας την εσφαλμένη αναδίπλωση.
Συνοπτικά, τα ριβοσώματα δεν είναι μόνο απαραίτητα για τη σύνθεση πρωτεϊνών, αλλά διαδραματίζουν επίσης κρίσιμο ρόλο στην ενεργοποίηση της αναδίπλωσης των πρωτεϊνών. Το δομημένο περιβάλλον του ριβοσώματος, οι σχετιζόμενες συνοδούς, η σήραγγα εξόδου και η αλληλεπίδραση με τους αναδίπλωση καταλύτες και το rRNA συμβάλλουν στην σωστή αναδίπλωση των πρωτεϊνών των εκκολαπτόμενων, εξασφαλίζοντας τη λειτουργικότητά τους και τους κυτταρικούς ρόλους τους.