Οι επιστήμονες δημοσιεύουν νέα έρευνα σχετικά με τον τρόπο με τον οποίο τα μεμονωμένα κύτταρα ανταποκρίνονται στην ιογενή λοίμωξη
Συγγραφείς:
[Κατάλογος των συνεισφερόντων επιστημόνων]
Περίληψη:
Οι ιογενείς λοιμώξεις αποτελούν σημαντικές απειλές για την παγκόσμια δημόσια υγεία, απαιτώντας βαθιά κατανόηση των περίπλοκων μηχανισμών με τους οποίους τα μεμονωμένα κύτταρα ανταποκρίνονται σε αυτές τις λοιμώξεις. Οι συμβατικές τεχνικές αλληλουχίας RNA που παρέχουν πολύτιμες πληροφορίες σχετικά με τη συνολική απόκριση του ξενιστή, αλλά συχνά καλύπτουν την ετερογένεια και τη δυναμική των κυτταρικών αποκρίσεων σε επίπεδο ενός κυττάρου. Σε αυτή τη μελέτη, χρησιμοποιούμε πρωτοποριακές αλληλουχίες RNA (scRNA-seq) και προηγμένες υπολογιστικές αναλύσεις για να αναλύουμε τον τρόπο με τον οποίο τα μεμονωμένα κύτταρα ανταποκρίνονται στην ιογενή λοίμωξη.
Χρησιμοποιώντας ένα συνδυασμό in vitro και in vivo μοντέλων, εμείς οι μεταβολές της γονιδιακής έκφρασης του προφίλ, των κυτταρικών καταστάσεων και των ενδοκυτταρικών αλληλεπιδράσεων κατά τη διάρκεια της ιογενούς λοίμωξης. Αναγνωρίζουμε ξεχωριστούς υποπληθυσμούς μολυσμένων κυττάρων και χαρακτηρίζουμε τις μοναδικές μεταγραφικές υπογραφές τους, αποκαλύπτοντας ένα υψηλό επίπεδο κυτταρικής ετερογένειας εντός του μολυσμένου ιστού. Τα ευρήματά μας ρίχνουν φως στη χρονική δυναμική της απόκρισης του ξενιστή, συμπεριλαμβανομένης της αρχικής ανίχνευσης της ιογενούς εισβολής, της ενεργοποίησης των αντιικών άμυνων και της διαμόρφωσης των αλληλεπιδράσεων ανοσοκυττάρων.
Με την ενσωμάτωση δεδομένων scRNA-seq με χωρική μεταγραφική και λειτουργικές δοκιμασίες, περιγράφουμε περαιτέρω την κυτταρική σύνθεση και τη χωρική οργάνωση των μολυσμένων ιστών. Αυτή η ολοκληρωμένη προσέγγιση μας επιτρέπει να αποκαλύψουμε συγκεκριμένες αλληλεπιδράσεις κυττάρου-κυττάρου και μονοπάτια σηματοδότησης που συμβάλλουν στην παθογένεση του ιού και στην άμυνα του ξενιστή.
Η μελέτη μας παρέχει έναν λεπτομερή χάρτη πορείας της κυτταρικής απόκρισης στην ιογενή λοίμωξη, υπογραμμίζοντας τη σημασία της ανάλυσης ενός κυττάρου για τη λήψη της πολυπλοκότητας των αλληλεπιδράσεων ξενιστή-παθογόνου. Οι νέες γνώσεις που αποκτήθηκαν από αυτό το έργο έχουν σημαντικές επιπτώσεις στην κατανόηση των μηχανισμών της παθογένεσης του ιού, τον εντοπισμό δυνητικών θεραπευτικών στόχων και την ανάπτυξη πιο αποτελεσματικών στρατηγικών για αντιιικές παρεμβάσεις.
Λέξεις -κλειδιά:
Μονό-κυτταρικό RNA-αλληλουχία, ιογενή λοίμωξη, κυτταρική ετερογένεια, απόκριση ξενιστή, παθογένεση ιογενούς, αντιιική ανοσία.