Η αλληλουχία του γονιδιώματος αποκαλύπτει πώς η Salmonella εξαλείφει μια θέση στην παραγωγή χοιρινού κρέατος
Περίληψη:
Το Salmonella enterica serovar typhimurium (S. typhimurium) είναι ένα σημαντικό τροφικό παθογόνο που μπορεί να προκαλέσει σοβαρή γαστρεντερίτιδα στους ανθρώπους. Το Pig είναι μια σημαντική φυσική δεξαμενή και μια ουσιαστική πηγή λοιμώξεων από ανθρώπινη σαλμονέλλωση παγκοσμίως. Η κατανόηση της γενετικής βάσης της προσαρμογής και αποικισμού S. typhimurium μέσα στο χοίρο είναι το κλειδί για την ανάπτυξη αποτελεσματικών παρεμβάσεων για τον έλεγχο της σαλμονέλας στα συστήματα παραγωγής χοιρινού κρέατος και τη μείωση των ανθρώπινων λοιμώξεων. Σε αυτή τη μελέτη, πραγματοποιήσαμε αλληλουχία ολόκληρου γονιδιώματος 200 απομονωθέντων στελεχών S. typhimurium που λαμβάνονται από διαφορετικές πηγές κατά μήκος της αλυσίδας παραγωγής χοιρινού κρέατος, συμπεριλαμβανομένων των χοίρων, των σφαγών και των προϊόντων χοιρινού κρέατος. Η συγκριτική γονιδιωματική ανάλυση αποκάλυψε την παρουσία διαφορετικών γονιδιωματικών παραλλαγών που σχετίζονται με κάθε στάδιο της αλυσίδας παραγωγής, υπογραμμίζοντας την ικανότητα των βακτηρίων να προσαρμοστούν στις διαφορετικές περιβαλλοντικές συνθήκες. Τα απομονωμένα στελέχη που φιλοξενούν συγκεκριμένα γονίδια μολυσματικότητας, όπως εκείνα που εμπλέκονται στην εντερική εισβολή και τη συστηματική εξάπλωση, βρέθηκαν πιο διαδεδομένα σε χοίρους από ό, τι σε άλλες πηγές, υποδεικνύοντας το επιλεκτικό πλεονέκτημα αυτών των γονιδίων για επιβίωση και επιμονή στον ξενιστή. Επιπλέον, εντοπίσαμε τα γονιδιωματικά νησιά μοναδικά για τα στελέχη S. typhimurium από χοίρους που θα μπορούσαν να συμβάλουν στην προσαρμογή και τον αποικισμό τους σε αυτό το είδος ξενιστή. Αυτά τα ευρήματα παρέχουν νέες ιδέες για τους γενετικούς μηχανισμούς προσαρμογής και εμμονής του ξενιστή Salmonella και εντοπίζουν δυνητικούς στόχους για τον έλεγχο της σαλμονέλας στην παραγωγή χοιρινού κρέατος και τη μείωση του κινδύνου ανθρώπινης λοίμωξης.
