Ποια γονίδια είναι ζωτικής σημασίας για τον ενεργειακό μεταβολισμό της Αρχαίας;
γονίδια που εμπλέκονται στη μεθανογένεση:
- μεθυλ-συνενζυμική αναγωγάση (MCR): Αυτό το σύμπλεγμα ενζύμου πολλαπλών υπομονάδων είναι υπεύθυνο για το τελικό βήμα της μεθανογένεσης, καταλύοντας τη μείωση του μεθυλ-συνένζυμου Μ σε μεθανίου.
- Formylmethanofuran Dehydrogenase (FMD): Ο FMD είναι ένα βασικό ένζυμο στη σύνθεση του μεθανίου από το διοξείδιο του άνθρακα. Μετατρέπει τη φορμαμεθανοπουράνη (ενδιάμεση μεθανογένεση) σε μεθανοπουράνη και διοξείδιο του άνθρακα.
γονίδια που εμπλέκονται στην ακετογένεση:
- φωσφοτρανσακετυλάση (PTA) και κινάση οξικού άλατος (ACK): Αυτά τα ένζυμα εμπλέκονται στη μετατροπή του ακετυλο-ΟοΑ σε οξικό. Η ΡΤΑ καταλύει τη μεταφορά μιας ομάδας φωσφορυλιωδών από ακετυλο-ΟοΑ σε φωσφορικό, παράγοντας φωσφορικό ακετυλίου, η οποία στη συνέχεια μετατρέπεται σε οξικό από ACK.
γονίδια που εμπλέκονται στη μείωση θειικού άλατος:
- θειική αδενυλελροτρανσφεράση (SAT) και 5'-φωσφοσουλφική αναγωγάση 5'-φωσφοσουλφικής αδενοσίνης (APR): Το SAT καταλύει την ενεργοποίηση του θειικού σχηματίζοντας 5'-φωσφοσουλφική αδενοσίνη (APS), ενώ το APR μειώνει τα ΑΡ σε θειώδη. Ο θειίτης στη συνέχεια μειώνεται περαιτέρω στο υδρόθειο κατά τη διάρκεια της μείωσης του θειικού άλατος.
γονίδια που εμπλέκονται στην αερόβια αναπνοή:
- Οξειδάση κυτοχρώματος C (CCO): Το CCO είναι μια τερματική οξειδάση που εμπλέκεται στην αλυσίδα μεταφοράς ηλεκτρονίων. Καταλύει τη μείωση του οξυγόνου στο νερό, δημιουργώντας μια κλίση πρωτονίων που οδηγεί τη σύνθεση ΑΤΡ.
γονίδια που εμπλέκονται στη φωτοσύνθεση:
- Bacteriorhodopsin (BR) και Halorhodopsin (HR): Αυτές είναι αντλίες πρωτονίων που βρίσκονται ελαφριά που βρίσκονται σε κάποια αρχαία. Τα BR και HR χρησιμοποιούν την ενέργεια του απορροφούμενου φωτός για να αντλούν πρωτόνια σε όλη την κυτταρική μεμβράνη, δημιουργώντας μια κλίση πρωτονίων που μπορεί να χρησιμοποιηθεί για σύνθεση ΑΤΡ.
γονίδια που εμπλέκονται στη ζύμωση:
- Οξειδοκαρδάση φερρεοξίνης πυροσταφυλικού άλατος (Pfor): Το Pfor καταλύει την οξειδωτική αποκαρβοξυλίωση του πυροσταφυλικού άλατος για την παραγωγή ακετυλο-ΟοΑ και διοξείδιο του άνθρακα. Αυτή η αντίδραση παράγει μειωμένη φερρεοξίνη, η οποία μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε αντιδράσεις που παράγουν ενέργεια.
Αυτά είναι μερικά παραδείγματα σημαντικών γονιδίων που εμπλέκονται στον ενεργειακό μεταβολισμό της Αρχαίας. Τα συγκεκριμένα γονίδια και οι ρόλοι τους μπορούν να ποικίλουν ανάλογα με τα αρχαϊκά είδη και τις ειδικές μεταβολικές ικανότητές του.