Γιατί οι Αρχάες και τα βακτηρίδια ομαδοποιήθηκαν από βιολόγους μέχρι πρόσφατα;
* Έλλειψη πυρήνα: Τόσο η αρχαιότητα όσο και τα βακτήρια στερούνται πυρήνα που συνδέεται με τη μεμβράνη, ο οποίος στεγάζει το γενετικό τους υλικό (DNA).
* Απλή δομή κυττάρων: Και οι δύο είναι μονοκύτταροι οργανισμοί με σχετικά απλές εσωτερικές δομές σε σύγκριση με τα ευκαρυωτικά κύτταρα.
* Μέγεθος: Τόσο η Archaea όσο και τα βακτηρίδια είναι γενικά μικρά σε μέγεθος, συνήθως μόνο λίγα μικρομετρικά σε διάμετρο.
* Παρόμοια εμφάνιση κάτω από μικροσκόπιο: Κάτω από ένα μικροσκόπιο, και οι δύο τύποι κυττάρων φαίνονται πολύ παρόμοιοι, χωρίς τις πολύπλοκες εσωτερικές δομές που παρατηρούνται σε ευκαρυωτικά.
Ωστόσο, οι εξελίξεις στη μοριακή βιολογία, ιδιαίτερα η ανάλυση του ριβοσωμικού RNA (rRNA), αποκάλυψαν σημαντικές διαφορές μεταξύ της αρχαιότητας και των βακτηρίων. Αυτές οι διαφορές οδήγησαν στην αναταξινόμηση της Αρχαίας ως ξεχωριστό τομέα της ζωής:
* Διακεκριμένες αλληλουχίες rRNA: Η Archaea έχει μια μοναδική αλληλουχία rRNA που είναι σημαντικά διαφορετική από τα βακτήρια, υποδεικνύοντας μια βαθύτερη εξελικτική απόκλιση.
* Διαφορετική σύνθεση κυτταρικού τοιχώματος: Τα κυτταρικά τοιχώματα των αρχαίων αποτελούνται από διαφορετικά μόρια από τα βακτηριακά κυτταρικά τοιχώματα.
* Διακεκριμένες μεταβολικές οδούς: Η Archaea έχει μοναδικές μεταβολικές οδούς που δεν βρίσκονται στα βακτήρια, συμπεριλαμβανομένης της ικανότητας να ευδοκιμούν σε ακραία περιβάλλοντα.
Αυτά τα μοριακά στοιχεία οδήγησαν τελικά στο σύστημα ταξινόμησης τριών πεδίων, το οποίο χωρίζει τη ζωή σε βακτήρια, αρχαία και ευκαρυα.