Τι κάνει τις πρωτεΐνες που μεταφέρονται μέσω του ενδοπλασματικού Rericulum;
Ακολουθεί μια ανάλυση των βασικών παραγόντων:
1. Ακολουθία σήματος:
* Τοποθεσία: Τυπικά βρίσκεται στο Ν-τελικό άκρο (αρχή) της πρωτεΐνης.
* Σύνθεση: Αποτελείται από 6-12 υδρόφοβα αμινοξέα.
* Λειτουργία: Αναγνωρίζει και δεσμεύεται σε ένα σύμπλεγμα που ονομάζεται σωματίδιο αναγνώρισης σήματος (SRP) .
2. Σωματίδιο αναγνώρισης σήματος (SRP):
* Δομή: Ένα σύμπλεγμα πρωτεϊνών και RNA.
* Λειτουργία: Δεσμεύεται με την ακολουθία σήματος και παύει προσωρινά τη μετάφραση πρωτεΐνης. Στη συνέχεια συνοδεύει το σύμπλοκο πολυπεπτιδίου ριβοσώματος-mRNA-NASCENT στη μεμβράνη ER.
3. Μεμβράνη ER:
* Docking: Το σύμπλοκο SRP-ribosome-mRNA αλληλεπιδρά με έναν υποδοχέα πρωτεΐνης στη μεμβράνη ER.
* κανάλι μετατόπισης: Οι σύνθετες αποβάθρες με ένα κανάλι πρωτεΐνης (translocon) στη μεμβράνη ER.
4. Μετατόπιση πρωτεΐνης:
* διάσπαση σήματος: Καθώς η πρωτεΐνη διέρχεται από το translocon, η αλληλουχία σήματος συνήθως διασκορπίζεται από πεπτιτάση σήματος.
* Αναδίπλωση και τροποποίηση: Μέσα στο ER, η πρωτεΐνη διπλώνει στη σωστή τρισδιάστατη δομή του και μπορεί να υποβληθεί σε περαιτέρω τροποποιήσεις (π.χ. γλυκοζυλίωση, σχηματισμός δισουλφιδικών δεσμών).
5. Ειδικά σήματα ταξινόμησης:
* Πρόσθετα σήματα: Ορισμένες πρωτεΐνες που προορίζονται για συγκεκριμένα διαμερίσματα ER (π.χ. η συσκευή Golgi) περιέχουν πρόσθετα σήματα ταξινόμησης που καθορίζουν τον τελικό προορισμό τους.
Συνοπτικά, οι πρωτεΐνες μεταφέρονται μέσω του ER επειδή:
* Διαθέτουν μια ακολουθία σήματος που τους κατευθύνει στη μεμβράνη ER.
* Η αλληλουχία σήματος συνδέεται με το SRP, το οποίο καθοδηγεί την πρωτεΐνη στο translocon ER.
* Η πρωτεΐνη μετατοπίζεται στον αυλό ER μέσω του καναλιού Translocon.
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι δεν μεταφέρονται όλες οι πρωτεΐνες μέσω του ER. Οι πρωτεΐνες που παραμένουν στο κυτταρόπλασμα στερούνται αλληλουχίας σήματος και συντίθενται με ελεύθερα ριβοσώματα.
